美洲黑杨群体结构分析及核心种质库构建

发布时间：2021-09-03 20:42

　　【目的】利用SSR分子标记技术研究美洲黑杨种质资源的群体结构,构建美洲黑杨核心种质资源库,为美洲黑杨种质资源的科学管理、高效利用和有效保护提供理论依据。【方法】利用15对SSR引物,分析美洲黑杨6个种源23个采样点的338个个体的遗传结构。应用Gene Al Ex 6.503等软件计算等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Shannon’s信息多样性指数（I）、观测杂合度（Ho）、Nei’s遗传多样性指数（H）和多态信息含量（PIC）等遗传参数,并进行主坐标（PCoA）分析。采用分组的逐步聚类方法结合位点等位基因数目最大化法和位点稀有等位基因优先相结合的取样策略构建核心种质库,并在核心种质库的基础上补充种质个体使等位基因保留比例达到100.00%,形成优化核心种质库。通过对相关遗传参数的t检验和PCoA分析验证核心种质库和优化核心种质库的有效性。【结果】美洲黑杨群体结构研究结果表明6个种源群体被划分为3大类型,即分布在圣劳伦斯河流域的Que种源的个体和哥伦比亚河流域的Was种源个体归为一类;分布在密西西比河中下游流域的种源个体（Mis、Lou、Ten）大致归为一类;分布在密西西比... 

【文章来源】：林业科学. 2020,56(09)北大核心EICSCD

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

美洲黑杨群体遗传结构

通过对比核心种质与原始种质检测位点的等位变异情况，发现核心种质在15个检测位点丢失了24个等位变异基因，在保留种质中挑选了15个美洲黑杨个体为补充种质，补充到核心种质中，形成优化核心种质库。优化核心种质库共包括34个美洲黑杨个体，筛选比例为10.06%(表3)。通过对比遗传参数可以看出优化核心种质库的等位基因保留比例达到100.00%，其他遗传参数(Ne、I、Ho、H、PIC)均高于原始种质库。与核心种质相比，Ne、I、H和PIC均增大，说明补充种质的加入提高了核心种质库的遗传多样性水平(表4)。通过t检验结果表明优化核心种质库与原始种质库之间的遗传多样性不存在显著差异，可以代表原始种质库的遗传多样性水平(表5)。通过对补充种质的PCo A分析，可以看出补充种质进一步扩大了核心种质的分布范围，使优化核心种质具有更好的代表性(图2)。3 讨论

【参考文献】：
期刊论文
[1]基于SSR分子标记构建南方型美洲黑杨初级核心种质[J]. 彭婵,樊孝萍,苏晓华,龙开莲,张新叶.  西北植物学报. 2019(02)
[2]基于等位基因最大化法初步构建杜仲核心种质[J]. 李洪果,许基煌,杜红岩,乌云塔娜,刘攀峰,杜庆鑫.  林业科学. 2018(02)
[3]利用表型性状构建杜仲雄性资源核心种质[J]. 李洪果,杜红岩,贾宏炎,谌红辉,许基煌,杜庆鑫,王璐.  分子植物育种. 2018(02)
[4]新疆野核桃核心种质的构建[J]. 张捷,张萍,李勤霞.  果树学报. 2018(02)
[5]一种简易高效提取多种植物纯净DNA的方法[J]. 丁浩,郑唐春,梁德洋,曲冠证.  植物研究. 2015(03)
[6]灰楸形态多样性分析及核心种质初步构建[J]. 李秀兰,贾继文,王军辉,麻文俊,马建伟,赵秋玲.  植物遗传资源学报. 2013(02)
[7]微卫星标记中的无效等位基因[J]. 文亚峰,Kentaro Uchiyama,韩文军,Saneyoshi Ueno,谢伟东,徐刚标,Yoshihiko Tsumura.  生物多样性. 2013(01)
[8]杨树抗逆转录因子基因内SSR标记的开发[J]. 王保垒,王博文,陈清清,李百炼,张德强.  林业科学. 2011(08)
[9]毛白杨木材形成功能基因内SSR标记的开发及评价[J]. 杜庆章,王博文,王保垒,张曼,李百炼,张志毅,张德强.  林业科学. 2010(11)
[10]小叶杨DREB同源基因内SSR的发现及群体结构分析[J]. 卫尊征,杜庆章,郭琦,张金凤,李百炼,张德强.  植物学报. 2010(05)

博士论文
[1]新疆野苹果（Malus sieversii）群体遗传结构与核心种质构建方法[D]. 张春雨.山东农业大学 2008

硕士论文
[1]我国辣椒种质资源遗传多样性分析及核心种质构建的研究[D]. 顾晓振.中国农业科学院 2016
[2]美洲黑杨遗传多样性分析与核心种质库构建[D]. 倪茂磊.南京林业大学 2011



本文编号：3381826