镉胁迫后旱柳转录组变化分析

发布时间：2021-10-10 19:21

　　随着重金属镉（Cd）应用范围的扩大,土壤Cd污染问题日益严重。以具有植物恢复潜力的旱柳（Saliz matsudana）作为研究对象,探究不同浓度的Cd胁迫后旱柳无性系1 d、7 d和30 d后基因表达与代谢通路的变化。转录组测序结果表明:共获得102 595个Unigenes,相同浓度不同时间的差异基因总数为26 623和32 154个;相同时间不同浓度的差异基因总数为8 550、3 444和11 428个。从中筛选得到与Cd胁迫响应密切相关的基因25个,其中金属硫蛋白、ABC转运蛋白、锌和锰转运蛋白等基因的表达不仅会随着Cd胁迫浓度变化而且同时受到胁迫时间的改变而发生改变;油菜素内酯合成通路的3,6-脱氧油菜素淄酮酶（ROT3）和黄酮类化合物合成通路的黄酮醇合成酶（FLS）、黄烷酮-3-羟化酶（F3H）均明显上调。此外旱柳响应Cd胁迫的GO条目主要集中在代谢过程、细胞过程、膜、细胞器、细胞、细胞部分、催化活化和结合蛋白上,参与这些GO条目的差异表达基因数随着Cd浓度和胁迫时间的增加而增加。通过转录组测序分析旱柳Cd胁迫后的响应机制,旨为旱柳修复土壤Cd污染提供理论指导。 

【文章来源】：生物技术通报. 2020,36(07)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 总RNA提取及样品检测
        1.2.2文库构建及转录组测序
        1.2.3 De nove组装
        1.2.4 生物信息学分析
        1.2.5 差异表达基因q-PCR验证
2 结果
    2.1 总RNA质检结果
    2.2 转录组测序与De nove组装
    2.3 对Unigene的功能注释
    2.4 Unigene GO功能分类
    2.5 Unigene的KEGG注释和代谢通路分析
    2.6 差异表达基因分析
    2.7 差异基因的q-PCR
3 讨论
4 结论


【参考文献】：
期刊论文
[1]西南鸢尾花色变异实时定量PCR内参基因的筛选与验证[J]. 马璐琳,崔光芬,王祥宁,贾文杰,段青,杜文文,王继华,陈发棣.  核农学报. 2019(09)
[2]油菜素内酯调控植物生长发育及产量品质研究进展[J]. 肖瑞雪,郭丽丽,贾琦石,郭大龙,侯小改.  江苏农业科学. 2019(10)
[3]土壤铅镉污染修复中植物修复技术的研究进展[J]. 张彩丽,陈磊,江懿,张成明.  中国沼气. 2019(02)
[4]植物油菜素内酯信号通路与植物免疫相关研究进展[J]. 王喆,王璐,宋旭明,金路,王霞,周国鑫.  安徽农业科学. 2019(04)
[5]3种植物对镉污染土壤修复的试验研究[J]. 刘沙沙,李兵,冯翔,冯园,李志娟,郭林,杨坡,张婷婷.  中国农学通报. 2018(22)
[6]油菜素内酯在植物抗逆中的作用及信号传导机制综述[J]. 靳开川,何金环.  江苏农业科学. 2017(14)
[7]小桐子雌雄花性别分化过程中潜在控制基因挖掘[J]. 周景龙.  绿色科技. 2017(10)
[8]植物耐重金属的分子生物学研究进展[J]. 迟春宁,丁国华.  生物技术通报. 2017(03)
[9]烟草FLS基因表达抑制对类黄酮代谢的影响[J]. 宋中邦,李文正,高玉龙,王丙武,师君丽,余玉珍,陈丽梅,李永平.  基因组学与应用生物学. 2016(12)
[10]黄酮类化合物对镉毒性营养干预分子机制的研究进展[J]. 白卫滨,李夏,朱翠娟,胡云峰,焦睿,蒋鑫炜,孙建霞.  食品科学. 2017(03)

博士论文
[1]柳树无性系镉积累和生理变化规律研究[D]. 徐爱春.中国林业科学研究院 2007



本文编号：3429003