水曲柳FmMYB转录因子生物信息学及表达模式分析

发布时间：2021-10-17 14:14

　　MYB蛋白广泛存在于植物中,参与植物生长发育等多种代谢途径。前期研究获得2个FmMYB转录因子cDNA全长序列（FmMYB2和FmMYB20）,已上传至NCBI并获得登录号（KT261341和KT261342）。为揭示FmMYB转录因子功能,对这两个MYB转录因子的结构特征、生化特性进行分析,利用实时荧光定量PCR,对FmMYB2和FmMYB20的时空表达模式以及施加应力后的转录水平进行分析。结果表明:FmMYB转录因子的时空表达模式有所差异,FmMYB2基因在7月相对表达量最高,约为最低值5月的60倍;然而在8月,FmMYB20基因的相对表达量最高,约为最低值5月的5倍;同时在叶、木质部、皮3个部位中,FmMYB2和FmMYB20基因在木质部中表达量最高。FmMYB2与FmMYB20基因均对应拉处理有响应,FmMYB20与木质素合成相关基因4CL表达模式相似。研究结果初步说明FmMYB2和FmMYB20可能参与木质素的合成。 

【文章来源】：黑龙江农业科学. 2020,(07)

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

FmMYB2和FmMYB20转录因子与其他物种的系统发育进化树

以5月作为对照，比较不同月份水曲柳叶子的基因相对表达量。结果表明（图5),FmMYB2基因在5月表达量逐渐升高，7月达到最大值，其相对表达量为5月的60倍，随后8-9月表达量逐渐降低，但仍高于5月；FmMYB20在5-7月表达量基本一致，8月叶片中的相对表达量最高，为5月的5倍，9月稍有降低，为5月的3倍。对FmMYB2和FmMYB20转录因子在叶片、木质部和皮3个部位的表达模式进行分析，结果表明：FmMYB2和FmMYB20基因表达量最低的部位均是叶片，表达量最高的部位是木质部。其中FmMYB2在木质部中的表达量是叶片中的24倍，在皮中的表达量是叶片的5倍。FmMYB20在木质部中的表达约为叶片中的5倍，在皮中的表达为叶片中的2倍（图6）。这些结果表明，水曲柳FmMYB基因具有时空表达特异性。2.5.2 应拉处理后FmMYB2和FmMYB20基因的表达水平分析

对水曲柳进行应拉处理，其中FmMYB2在第1天的OW表达量升高，约为对照的2倍，而TW表达量基本不变，第7天时二者表达量均低于对照；FmMYB20的表达量，在第1天TW较高，约为对照的2.5倍，第3天FmMYB20的表达量，无论TW还是OW均有所上升，分别为对照的7倍和4倍，第7天有所下降，但仍高于对照（图7）。可见2个基因表达模式虽不相同，但均对应拉处理有响应，初步说明FmMYB可能参与细胞壁木质素的合成。图7 水曲柳应拉木FmMYB2和FmMYB20基因表达水平

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3441901