木麻黄青枯病抗性与EST-SSR标记的关联分析

发布时间：2022-08-02 19:40

　　为挖掘与木麻黄（Casuarina equisetifolia）青枯病抗性（bacterial wilt resistance,BWR）相关的分子标记及其有效等位变异,加速抗病品种的选育进程,以53份木麻黄种质为自然群体材料,利用223个木麻黄EST-SSR标记对抗、感池进行标记分型与筛选,选择Structure 2.3.4软件进行群体结构分析,SPAGeDi1-5a软件计算亲缘关系系数,TASSEL软件的混合线性模型（MLM）进行标记与抗病性状的关联分析。利用抗、感基因池筛选出用于关联分析且不偏离哈-温平衡的标记47个;群体结构分析将木麻黄种质分为2个组群;关联分析发现CASeSSR253、CASeSSR022、CASeSSR359、CASeSSR241、CASeSSR242、CASeSSR263、CASeSSR056、CASeSSR052、CASeSSR176、CASeSSR258等10个ESTSSR标记位点与木麻黄青枯病抗性显著相关（P <0.05）,对青枯病抗性的解释率在12.6%～60.1%之间;CASeSSR359-386 bp、CASeSSR359-370 bp、C... 

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 DNA提取与标记分型
    1.3 数据分析
        1.3.1 群体结构及关联分析
        1.3.2 等位变异表型效应分析
2 结果与分析
    2.1 木麻黄EST-SSR标记分型与筛选
    2.2 群体结构分析
    2.3 关联分析
    2.4 位点和等位片段的表型效应
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]全基因组关联分析（GWAS）在林木育种中的应用[J]. 阙青敏,欧阳昆唏,李培,陈晓阳.  植物生理学报. 2019(11)
[2]山西谷子核心资源群体结构及主要农艺性状关联分析[J]. 王海岗,温琪汾,穆志新,乔治军.  中国农业科学. 2019(22)
[3]辣椒疫病抗性关联分析及优异等位变异挖掘[J]. 袁欣捷,方荣,周坤华,马辉刚,何烈干,陈学军.  植物遗传资源学报. 2019(04)
[4]SSR标记与陆地棉田间黄萎病抗性的关联分析[J]. 张素君,唐丽媛,李兴河,王海涛,刘存敬,张香云,张建宏.  华北农学报. 2018(06)
[5]烟草种质的SSR标记遗传多样性及青枯病抗性的关联分析[J]. 赖瑞强,李荣华,夏岩石,郭培国,袁清华,赵伟才.  中国烟草学报. 2018(06)
[6]全基因组测序技术研究及其在木本植物中的应用[J]. 刘海琳,尹佟明.  南京林业大学学报(自然科学版). 2018(05)
[7]51个木麻黄无性系遗传多样性的ISSR分析[J]. 许秀玉,王明怀,魏龙,徐斌.  林业科学研究. 2012(06)
[8]改进的CTAB提取植物DNA方法[J]. 李荣华,夏岩石,刘顺枝,孙莉丽,郭培国,缪绅裕,陈健辉.  实验室研究与探索. 2009(09)
[9]分子生物技术在木麻黄科植物研究中的应用[J]. 黄桂华,仲崇禄,苏晓华,张勇,C.Franche,D.Bogusz.  广东林业科技. 2006(03)
[10]我国木麻黄科植物遗传改良研究进展[J]. 黄桂华,仲崇禄,张勇.  广东林业科技. 2005(04)

博士论文
[1]木麻黄青枯病的抗性鉴定及EST-SSR关联分析[D]. 许秀玉.中国林业科学研究院 2017



本文编号：3669125