基于转录组测序的硒处理银杏萜类合成的关键基因表达分析

发布时间：2023-02-10 20:43

　　本研究以银杏叶品种(Ginkgo biloba L.)家佛手室内盆栽为试材,对3年生银杏幼苗进行亚硒酸钠叶面喷洒处理,并分析其萜内酯相关基因的表达变化。挖掘与萜类化合物合成相关基因并对其差异表达基因进行筛选和分析,研究结果表明,亚硒酸钠处理叶片转录组测序共获得142 834条Unigene,平均长度656 bp,基因差异表达(DEG)筛选得到5 292个基因,并将其进行KOG功能分类。通过对萜类化合物合成相关KEGG途径进行分析,筛选出6条候选基因。采用实时荧光定量(qRT-PCR)对选取的候选差异基因进行验证,其中DXS、MECT、HMGR上调表达,与转录组测序结果一致,而DXR、MECPs、MVD在转录组测序中虽无明显差异,但q RT-PCR结果表明其在硒处理后的5周内就有明显差异变化。本实验为银杏提供了较为全面的基因信息和代谢途径数据,为硒处理条件下银杏分子调控机制的深入研究奠定基础。

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 测序结果和注释数据
        1.1.1 测序数据质量分析
        1.1.2 测序数据注释信息分析
        1.1.3 KOG功能分类
    1.2 基因功能分析与差异表达基因筛选
        1.2.1 萜内酯生物合成相关基因筛选
        1.2.2 差异表达基因的KEGG富集分析
    1.3 差异基因及其实时荧光定量验证分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 材料
    3.2 转录组测序与分析
    3.3 实时荧光定量PCR分析
作者贡献



本文编号：3739880