干旱胁迫下白沙蒿SIP2-1的表达和序列分析

发布时间：2023-02-15 18:47

　　水通道蛋白家族(Aquaporins)的成员在植物体中起着膜通道的作用。基于转录组测序,对在干旱胁迫下呈显著下调表达的白沙蒿水通道蛋白基因AsSIP 2-1进行生物信息学分析。结果显示:AsSIP 2-1的cDNA序列的开放阅读框全长1 191 bp,共编码235个氨基酸;属于水通道蛋白SIP2-1家族的成员;AsSIP 2-1与5个参考物种的比对结果显示6个物种的总体同源性为82.92%,并具有SIP2-1家族的特有的NPL和NPA保守性结构域; AsSIP 2-1的等电点为9.32;分子量为26.145 kDa;分子式为C₁₂₁₈H₁₈₉₃N₃₀₁O₃₁₇S₁₀;属于疏水性、稳定性蛋白;具有内质网膜保留信号EKKT基序;具有6个跨膜区,属于跨膜蛋白;无信号肽,属于非分泌蛋白。在干旱迫下,AsSIP 2-1表达量显著下调,参与了应答反应。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料与种植方法
    1.2 研究方法
        1.2.1 干旱胁迫处理方法
        1.2.2 白沙蒿水通道蛋白基因的获取方法
        1.2.3 生物信息学分析方法
2 结果与分析
    2.1 白沙蒿水通道蛋白(AsSIP 2-1)在干旱胁迫下表达量分析
    2.2 同源性比对分析及亚细胞定位分析
    2.3 跨膜结构预测及信号肽预测
    2.4 理化性质分析
3 讨论
4 结论



本文编号：3743638