金线莲应答高温胁迫的蛋白质组学分析
发布时间：2021-08-16 11:57
金线莲是传统的名贵中药材,以耐热品系金线莲NYJ2为研究对象,分析其在蛋白质水平上对高温胁迫的响应。通过比较高温胁迫前后NYJ2叶片蛋白质组学的变化,获得二级图谱326 478个,匹配到34 376个,鉴定到肽段9 804个,蛋白质2 534个,大多数肽段分布的长度在7～25 aa。通过对高温胁迫前后蛋白质数量和种类的差异分析,共获得143个差异表达的蛋白质,其中,40个蛋白质上调表达,103个下调表达,HSP20家族的基因（HSP17.4）编码蛋白质、病程相关蛋白质（PR）、谷胱甘肽S-转移酶（GSTF1）、过氧化氢酶（CAT）的表达差异较多。另外,在KOG功能分类中发现有112个功能不明确的蛋白质,223个信号转导机制蛋白质。通过分析NYJ2在蛋白质组学层面对热胁迫的响应,为金线莲耐热栽培提供了参考依据。
【文章来源】：江苏农业学报. 2020,36(06)北大核心CSCD
【文章页数】：9 页
【部分图文】：
蛋白质基本鉴定信息统计
从高温胁迫前后金线莲叶片中蛋白质的相对分子质量大小来看,鉴定出来的蛋白质相对分子质量主要集中在10 000～80 000,其数量约占总蛋白质数量的83.94%,其中相对分子质量为20 000～30 000和30 000～40 000的蛋白质数量分别为439个和429个,分别占总蛋白质数量的17.32%和16.93%;相对分子质量为0～10 000的蛋白质数量占总蛋白质数量的3.28%,相对分子质量为80 000～100 000的蛋白质数量占总蛋白质数量的5.25%,相对分子质量>100 000的蛋白质数量占总蛋白质数量的7.54%左右(图2)。2.1.2 肽段长度分布
对高温胁迫前后获得的所有金线莲叶片的蛋白质进行GO功能注释,主要对分子功能、生物学过程和细胞组分中所涉及的GO条目及相应的蛋白质ID和数量进行统计分析,并略去没有相应蛋白质的GO条目。结果显示,所有鉴定到的蛋白质被注释到41个GO条目中(图5)。在生物学过程中,注释蛋白质数量较多的是代谢过程、细胞过程和单一生物体过程,分别为1 584个、1 342个、1 205个;在分子功能中,催化活性和结合的注释蛋白质数量较多,分别为1 317个和1 135个;在细胞组分中,细胞和细胞器的注释蛋白质数量较多,分别为1 470个和1 207个。图4 不同肽段数量蛋白质的数量分布
【参考文献】：
期刊论文
[1]高温胁迫下外源壳聚糖对黄瓜幼苗生长的影响[J]. 王涛,黄语燕,陈永快,廖水兰,刘现,康育鑫. 江苏农业科学. 2019(23)
[2]金线莲及其混伪品中总黄酮含量的比较研究[J]. 张超,易骏,张若青,杨淑玲,叶齐,吴建国,吴锦忠,吴岩斌,郑承剑. 药学实践杂志. 2019(06)
[3]高温胁迫对3个番茄品种生长和生理指标的影响[J]. 赵勇竣,徐术菁,王钊,李莉,刘桂伶. 江苏农业科学. 2019(17)
[4]高温干旱胁迫对黄薇抗氧化防御系统的影响[J]. 顾帆,季梦成,顾翠花,郑钢,郑绍宇. 浙江农林大学学报. 2019(05)
[5]白花虎眼万年青QtJMT基因的克隆及其植物表达载体的构建[J]. 姜福星,赵婕,孙晓兰,宋贤,陈其兵. 分子植物育种. 2019(10)
[6]花楸树热激蛋白70基因的克隆及表达分析[J]. 刘聪聪,张泽,关雪莲,裴鑫,郑健. 分子植物育种. 2019(19)
[7]外源水杨酸对高温胁迫微型月季生理指标的影响[J]. 覃泳智,周智丽,刘海涛,王燕,赖永超,王燕君,毛丰伟,张乐平,王鸿昌,张广燕. 南方农业学报. 2018(10)
[8]药用植物蛋白质组学的研究进展[J]. 付强,赵杰宏,刘育辰,邹颉. 贵州农业科学. 2018(10)
[9]筛选金线莲种质资源的通用DNA条形码序列及鉴定其混伪品[J]. 梅瑜,邱道寿,肖深根,彭淼,陈栋. 分子植物育种. 2019(15)
[10]高温胁迫对不同耐热性茄子叶肉细胞超微结构的影响[J]. 李艳艳,王俊青,李植良,孙保娟. 江苏农业科学. 2018(18)
本文编号：3345627
【文章来源】：江苏农业学报. 2020,36(06)北大核心CSCD
【文章页数】：9 页
【部分图文】：
蛋白质基本鉴定信息统计
从高温胁迫前后金线莲叶片中蛋白质的相对分子质量大小来看,鉴定出来的蛋白质相对分子质量主要集中在10 000～80 000,其数量约占总蛋白质数量的83.94%,其中相对分子质量为20 000～30 000和30 000～40 000的蛋白质数量分别为439个和429个,分别占总蛋白质数量的17.32%和16.93%;相对分子质量为0～10 000的蛋白质数量占总蛋白质数量的3.28%,相对分子质量为80 000～100 000的蛋白质数量占总蛋白质数量的5.25%,相对分子质量>100 000的蛋白质数量占总蛋白质数量的7.54%左右(图2)。2.1.2 肽段长度分布
对高温胁迫前后获得的所有金线莲叶片的蛋白质进行GO功能注释,主要对分子功能、生物学过程和细胞组分中所涉及的GO条目及相应的蛋白质ID和数量进行统计分析,并略去没有相应蛋白质的GO条目。结果显示,所有鉴定到的蛋白质被注释到41个GO条目中(图5)。在生物学过程中,注释蛋白质数量较多的是代谢过程、细胞过程和单一生物体过程,分别为1 584个、1 342个、1 205个;在分子功能中,催化活性和结合的注释蛋白质数量较多,分别为1 317个和1 135个;在细胞组分中,细胞和细胞器的注释蛋白质数量较多,分别为1 470个和1 207个。图4 不同肽段数量蛋白质的数量分布
【参考文献】：
期刊论文
[1]高温胁迫下外源壳聚糖对黄瓜幼苗生长的影响[J]. 王涛,黄语燕,陈永快,廖水兰,刘现,康育鑫. 江苏农业科学. 2019(23)
[2]金线莲及其混伪品中总黄酮含量的比较研究[J]. 张超,易骏,张若青,杨淑玲,叶齐,吴建国,吴锦忠,吴岩斌,郑承剑. 药学实践杂志. 2019(06)
[3]高温胁迫对3个番茄品种生长和生理指标的影响[J]. 赵勇竣,徐术菁,王钊,李莉,刘桂伶. 江苏农业科学. 2019(17)
[4]高温干旱胁迫对黄薇抗氧化防御系统的影响[J]. 顾帆,季梦成,顾翠花,郑钢,郑绍宇. 浙江农林大学学报. 2019(05)
[5]白花虎眼万年青QtJMT基因的克隆及其植物表达载体的构建[J]. 姜福星,赵婕,孙晓兰,宋贤,陈其兵. 分子植物育种. 2019(10)
[6]花楸树热激蛋白70基因的克隆及表达分析[J]. 刘聪聪,张泽,关雪莲,裴鑫,郑健. 分子植物育种. 2019(19)
[7]外源水杨酸对高温胁迫微型月季生理指标的影响[J]. 覃泳智,周智丽,刘海涛,王燕,赖永超,王燕君,毛丰伟,张乐平,王鸿昌,张广燕. 南方农业学报. 2018(10)
[8]药用植物蛋白质组学的研究进展[J]. 付强,赵杰宏,刘育辰,邹颉. 贵州农业科学. 2018(10)
[9]筛选金线莲种质资源的通用DNA条形码序列及鉴定其混伪品[J]. 梅瑜,邱道寿,肖深根,彭淼,陈栋. 分子植物育种. 2019(15)
[10]高温胁迫对不同耐热性茄子叶肉细胞超微结构的影响[J]. 李艳艳,王俊青,李植良,孙保娟. 江苏农业科学. 2018(18)
本文编号：3345627
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