饲料作物的同源基因数据库构建及对农用饲料方面的应用

发布时间：2021-09-22 11:23

　　随着玉米、水稻、小麦等多种饲料作物的不同版本参考基因组序列陆续公布,基因组学研究已进入"泛基因组时代"。针对现有的饲料作物同源基因查询数据库,仅考虑每个饲料作物中的一个参考基因组已不能满足不同饲料作物物种多版本基因组的同源基因查询研究需求。在中国农业大学小麦研究中心构建的"小麦族GeneTribe"同源基因数据库基础上,通过构建多饲料作物的泛基因组同源基因数据库GenelnterTribe,实现不同饲料作物同源基因可查询,推动大数据时代农业研究进入新的境界。 

【文章来源】：中国饲料. 2020,(24)北大核心

【文章页数】：4 页

【文章目录】：
1 多种饲料作物基因共线性分析
2 多饲料作物泛基因组同源基因数据库的传递性原理分析
    2.1 传递性分析的总的算法核心原理
    2.2 使用公认的参考基因组进行跨物种亲缘关系比对
    2.3 通过“假基因组”即人造基因组进行物种与物种之间亲缘关系的比对算法
3 多饲料作物泛基因组同源基因数据库的搭建流程及文件基础
4 多作物泛基因组同源基因数据库在饲料方面的前景
    4.1 探寻不同饲料作物之间的亲缘关系，评估成为潜在饲料作物的可能性
    4.2 提升饲料作物的产量和品质
    4.3 为饲料作物分子育种提供指导


【参考文献】：
期刊论文
[1]高粱PHD-Finger基因家族的鉴定、分类及表达特征分析[J]. 杨溥原,崔江慧,任根增,高玉坤,魏世林,常金华.  山地农业生物学报. 2020(04)
[2]小麦Dof转录因子家族全基因组鉴定和表达分析[J]. 任永康,牛瑜琦,逯成芳,唐朝晖.  河南农业科学. 2020(09)
[3]小麦基因组研究现状与展望[J]. 傅向东,刘倩,李振声,张爱民,凌宏清,童依平,刘志勇.  中国科学院院刊. 2018(09)

博士论文
[1]基于高通量测序技术的小麦和紫茎泽兰基因组学初步研究[D]. 聂小军.西北农林科技大学 2013



本文编号：3403677