马铃薯AS2基因家族的鉴定与逆境胁迫表达

发布时间：2022-07-13 10:33

　　高盐、干旱、高温、低温等非生物胁迫是造成马铃薯减产的重要因素,鉴定和探究马铃薯逆境胁迫应答相关基因对马铃薯生产具有重要意义. ASYMMETRIC LEAVES2（AS2）基因家族是一类广泛存在于植物中的转录因子家族,在植物生长发育和抵御逆境胁迫过程中发挥重要作用.通过生物信息学系统分析,鉴定得到43个马铃薯AS2基因家族成员.结果显示,根据保守结构域的差异将AS2基因家族分为ClassⅠ、ClassⅡ两类,其中ClassⅠ分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe共5个亚类,ClassⅡ分为Ⅱa、Ⅱb两个亚类.马铃薯AS2蛋白主要以α-螺旋和不规则卷曲两种二级结构组成,定位在细胞核中.通过对马铃薯植株进行高盐、干旱、低温和高温胁迫处理,并对叶片和根中部分AS2基因家族成员的表达量进行分析,发现ClassⅠ类和ClassⅡ类中大部分成员均参与逆境胁迫应答,但在不同逆境胁迫下的响应程度存在差异.高盐胁迫下,叶片中St AS2-7和根中St AS2-27表达量分别是对照的10倍;干旱胁迫下,除St AS2-4外的其余成员在叶片和根部表达量明显上调;高温胁迫下,叶片中St AS2-15表达量下调,其余... 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 马铃薯AS2基因家族鉴定和染色体定位
    1.3 马铃薯AS2基因家族演化分析
    1.4 马铃薯AS2基因家族二级结构预测
    1.5 马铃薯AS2基因成员芯片表达模式分析
    1.6 qRT-PCR分析
2 结果与分析
    2.1 马铃薯AS2基因家族成员鉴定和染色体定位
    2.2 马铃薯AS2基因家族成员分类与演化分析
    2.3 马铃薯AS2基因家族蛋白质二级结构分析
    2.4 马铃薯AS2基因家族成员应激表达
    2.5 马铃薯AS2基因家族成员实时荧光定量分析
3 讨论与结论
    3.1 马铃薯AS2基因家族成员系统发育特征
    3.2 马铃薯AS2基因家族成员响应植物激素诱导
    3.3 马铃薯AS2基因家族成员响应非生物胁迫


【参考文献】：
期刊论文
[1]葡萄LBD基因家族的鉴定与表达分析[J]. 何红红,马宗桓,张元霞,张娟,卢世雄,张志强,赵鑫,吴玉霞,毛娟.  中国农业科学. 2018(21)
[2]植物应答非生物胁迫信号传导研究进展[J]. 刘铃,武小龙,诸葛强.  分子植物育种. 2018(02)
[3]毛果杨LBD基因家族的全基因组分析[J]. 芦强,邵芬娟,邱德有.  基因组学与应用生物学. 2018(01)
[4]番茄AS2基因家族的系统进化分析[J]. 刘洋,郑洋洋,宫超,程谟桢,黄海峰,张瑶,陈秀玲,王傲雪.  基因组学与应用生物学. 2018(09)
[5]大麦ASYMMETRIC LEAVES2/LATERAL OR-GAN BOUNDARIES（AS2/LOB）基因家族的全基因组分析（英文）[J]. Bao-jian GUO,Jun WANG,Shen LIN,Zheng TIAN,Kai ZHOU,Hai-ye LUAN,Chao LYU,Xin-zhong ZHANG,Ru-gen XU.  Journal of Zhejiang University-Science B（Biomedicine ＆ Biotechnology）. 2016(10)
[6]马铃薯主粮化与产业开发研究综述[J]. 张千友,王万疆,廖武霜.  西昌学院学报(自然科学版). 2016(02)
[7]辣椒全基因组中LBD转录因子的鉴定与表达分析[J]. 郑忠凡,张亚利,胡灿,戴雄泽,刘峰,袁祖华.  园艺学报. 2016(04)
[8]普通烟草LBD基因家族的全基因组序列鉴定与表达分析[J]. 孙亭亭,龚达平,张磊,陈雅琼,赵维,向小华,孙玉合.  植物遗传资源学报. 2016(02)



本文编号：3659881