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香鳞毛蕨DfTCP的生物信息学及其表达模式分析

发布时间:2022-08-01 13:37
  为探究香鳞毛蕨DfTCP基因应答外源激素和非生物胁迫的响应机制,以香鳞毛蕨幼苗为材料,在外源激素(SA、ABA、MeJA和Eth)、盐(200 mmol/L NaCl)、干旱(20%PEG)、高温(42℃)及低温(4℃)处理下,分别于0,0.5,1,3,6,12,24,48 h取样,对DfTCP进行生物信息学分析和表达模式分析。结果表明:DfTCP基因CDS全长1 431 bp,编码477个氨基酸,含有一个保守的bHLH结构域,定位于细胞外;DfTCP蛋白二级结构为mixed型;香鳞毛蕨不同组织中DfTCP的相对表达量为叶柄>叶>根;外源激素SA处理下,香鳞毛蕨叶片中DfTCP的相对表达量表现为"升-降-升-降"的趋势,在0.5,12 h达到峰值,极显著高于对照;ABA处理下,DfTCP的相对表达量整体上调且呈现先升后降的趋势,仅0.5 h香鳞毛蕨叶片中DfTCP的相对表达量与对照组差异不显著;MeJA和Eth处理后,香鳞毛蕨叶片中DfTCP的相对表达量均随处理时间的增长表现为"降-升-降"的趋势,分别在6,1 h达到峰值且与对照差异极显著;在PEG和NaCl条件下处理,香... 

【文章页数】:8 页

【文章目录】:
1 材料和方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验方法
        1.2.1 RNA提取和实时荧光定量PCR分析
        1.2.2 生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 DfTCP蛋白的理化性质
    2.2 DfTCP蛋白质二级和三级结构预测
    2.3 DfTCP蛋白质多序列比对
    2.4 DfTCP蛋白质系统进化树和Motif结构分析
    2.5 DfTCP基因在香鳞毛蕨中的组织表达特异性
    2.6 外源激素(SA、ABA、MeJA和Eth)对香鳞毛蕨叶片DfTCP基因表达模式的影响
    2.7 非生物胁迫(干旱、盐、高温和低温)对香鳞毛蕨叶片DfTCP基因表达模式的影响
3 结论与讨论


【参考文献】:
期刊论文
[1]茶树TCP转录因子的鉴定与表达分析[J]. 温贝贝,罗勇,刘冬敏,张向娜,李娟,王英姿,王坤波,黄建安.  园艺学报. 2019(12)
[2]TCP转录因子与激素信号相互作用研究进展[J]. 雷豆,吴雨,苏周,何卓远,韦小英,邹建,杨军.  分子植物育种. 2019(09)

硕士论文
[1]温度和pH等对香鳞毛蕨孢子萌发及配子体发育过程的影响[D]. 陈忠.中国农业科学院 2014



本文编号:3667549

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