基于简化基因组的甜叶菊分子标记开发

发布时间：2022-09-17 13:11

　　本研究旨在筛选和开发具有多态性的甜叶菊基因组分子标记。选取4个甜叶菊品种为材料,利用简化基因组测序技术（RAD-seq）开发SSR和SNP标记。开发并验证了149对多态性丰富、重复性好、特异性高的简单重复序列（SSR）和4组功能性的SNP标记,开发的多态性基因组分子标记中包含了甜叶菊糖苷合成途径关键基因的新标记StKASPSNP-7。验证了基于KASP技术开发甜叶菊功能SNP标记的可行性,为甜叶菊遗传图谱构建、分子鉴定奠定了基础。本研究开发的SSR和SNP标记可应用于甜叶菊的遗传图谱分析、品种真实性的高效快速鉴定以及高糖苷含量新品种的开发。 

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
    1.1 试验时间、地点
    1.2 试验材料
    1.3 主要试剂与仪器
    1.4 DNA提取、PCR扩增及电泳检测
    1.5 SNP检测
2 结果与分析
    2.1 甜叶菊简化基因组的基本特征
    2.2 基于RAD-seq的SSR标记开发与引物有效性分析
    2.3 基于KASP技术的甜叶菊功能SNP标记开发和应用
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]甜叶菊EST序列特征分析与分子标记开发[J]. 盛文涛,邓建兰,饶友生,柴学文,邹鑫.  分子植物育种. 2019(15)
[2]甜菊糖苷积累与其生物合成基因表达的关系[J]. 朱静雯,郭书巧,束红梅,巩元勇,蒋璐,倪万潮.  植物遗传资源学报. 2017(04)
[3]甜菊糖苷含量跃变的理化特性分析[J]. 胡秀英,王仲伟,黄苏珍.  中国糖料. 2016(04)
[4]世界甜叶菊发展概况[J]. 吴则东,张文彬,吴玉梅,刘乃新.  中国糖料. 2016(04)
[5]甜叶菊微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J]. 秦海峰,龙宁,吴建国,石春海.  作物学报. 2014(03)
[6]甜叶菊葡糖基转移酶基因UGT76G2的克隆及生物信息学分析[J]. 郭书巧,杨郁文,倪万潮.  基因组学与应用生物学. 2009(03)
[7]薄板层析法分析甜叶菊糖苷[J]. 张志,滕祥金,郝再彬.  中国调味品. 2009(03)
[8]甜菊及甜菊糖研究进展[J]. 胡献丽,董文宾,郑丹,杨兆艳.  食品研究与开发. 2005(01)



本文编号：3679287