不同重楼变种间内生真菌群落多样性差异及生物标记物初探

发布时间：2022-09-17 22:47

　　目的通过对不同变种重楼内生真菌群落多样性研究及生物标记物分析,为中药材重楼多基源质量等同性及鉴别溯源技术的开发研究奠定基础。方法采用Illmina Hiseq高通量测序技术对3个变种的重楼内生真菌群落基因进行扩增子序列测定,同时对菌群多样性、真菌群落差异进行生物信息学分析。结果对不同变种重楼内生真菌进行多样性分析结果显示,七叶一枝花Paris polyphylla Smith var. chinensis （Franch.） Hara、长药隔重楼Paris polyphylla Sm. var. thibetica （Franch.） Hara、具柄重楼Paris fargesii Franch. var. petiolate （Baker ex C. H. Wright） Wang et Tang三者的内生真菌的α多样性存在差异,但β多样性无显著性差异,具柄重楼中特有的OTU仅为0.27%。真菌群落注释结果表明,3个变种分别注释到6个相同的门,但组成比率不同。另外,通过LEfSe分析,初步探索了3个变种的生物标记物差异,七叶一枝花中Rhizophagus irregularis与其他... 

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 材料与仪器
    1.1 材料
    1.2 主要试剂与仪器
2 方法
    2.1 样品前处理
    2.2 DNA提取
    2.3 PCR扩增与测序
    2.4 数据统计与分析
3 结果与分析
    3.1 数据质量分析
    3.2 不同变种内生真菌菌群落的多样性分析
    3.3 不同变种的重楼内生菌β多样性分析
    3.4 不同变种重楼真菌群落组成多样性分析
    3.5 不同变种间OTU分布Venn分析
    3.6 重楼不同变种间菌群差异显著性分析
4 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于高通量测序揭示重楼根际土及不同部位真菌群落差异[J]. 程虎印,王艳,赵乐,万一,程江雪,高静,成世强,王汉屏.  药物分析杂志. 2020(03)
[2]重楼属植物化学成分、药理作用研究进展及质量标志物预测分析[J]. 管鑫,李若诗,段宝忠,王莹,范敏,王双,张海珠,夏从龙.  中草药. 2019(19)
[3]重楼根际及药用部位内生真菌多样性与群落结构差异分析[J]. 王艳,常帆,程虎印,贾凤安,程江雪,王汉屏.  中草药. 2019(05)
[4]Illumina MiSeq高通量测序分析不同品种桑树内生细菌多样性[J]. 吴燕燕,徐伟芳,罗琴,王玲莉,刘祎杨,陈凯,谢洁.  蚕学通讯. 2018(03)
[5]基于DNA条形码技术的重楼栽培品基原鉴定[J]. 过立农,刘杰,朱玲,昝珂,郑健,马双成,李昀铮.  药物分析杂志. 2018(05)
[6]陕产重楼属南重楼组药用植物类群及资源调查[J]. 程虎印,颜永刚,程江雪,张岗,刘亮亮,彭亮,杨新杰,高静,杨哲.  中国中医药信息杂志. 2018(03)
[7]历代本草重楼基原考[J]. 蒋露,康利平,刘大会,彭华胜,谢晋,陈敏.  中国中药杂志. 2017(18)
[8]重楼属植物化学成分及药理活性研究进展[J]. 杨远贵,张霁,张金渝,王元忠.  中草药. 2016(18)
[9]重楼活性化学成分与药理作用研究进展[J]. 张亚茹,彭献娜,王彩虹,刘艺华,高嘉屿.  亚太传统医药. 2015(02)
[10]植物内生菌研究及其科学意义[J]. 王志伟,纪燕玲,陈永敢.  微生物学通报. 2015(02)

硕士论文
[1]道地产区丹参内生真菌组成及其功能的初步研究[D]. 王萌.成都中医药大学 2013
[2]土壤微生物对药材白术生物学产量和品质影响的研究[D]. 仇有文.西南交通大学 2007



本文编号：3680083