三种石豆兰属药用植物的叶绿体基因组比较分析及其在物种鉴定中的意义

发布时间：2022-10-10 16:13

　　石豆兰属（Bulbophyllum）植物具有极高的观赏和药用价值,然而有关其系统发育关系和物种鉴定仍缺乏研究。因此,本研究对石豆兰属3种药用植物（赤唇石豆兰、长足石豆兰、富宁卷瓣兰）的叶绿体基因组进行了测序分析,并以此为基础开展了相应研究。经组装注释后发现,石豆兰属植物叶绿体基因组共编码108个基因,其中蛋白质编码基因74个、转运RNA基因30个、核糖体RNA基因4个。基于mVISTA和节点处比较分析发现,石豆兰属植物叶绿体基因组结构较为保守,差异主要存在于非编码区。系统进化分析表明,石豆兰属与石斛属亲缘关系最近。SSR分析显示单核苷酸重复数目最多,且大部分SSR位点存在于基因间隔区。此外,对非编码序列进行比较分析,共筛选出10个高变序列,其中psbI-trnS、psbC-trnS、clpP-ex1-psbB、psaJ-rpl33、rpl33-rps18这5个非编码区序列的组合,具有最高的序列变异度,可用于石豆兰属药用植物的鉴定研究。综上可知,本研究通过对石豆兰属植物叶绿体基因组的比较分析,为系统发育关系和物种鉴定提供了理论依据。 

【文章页数】：10 页

【文章目录】：
材料与方法
结果与分析
    1石豆兰叶绿体基因组基本特征
    2 m VISTA分析
    3节点扩张收缩
    4 SSR位点分析
    5石豆兰的系统进化关系
    6非编码区变异度计算和高变序列的筛选与验证
讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]Accurate authentication of Dendrobium officinale and its closely related species by comparative analysis of complete plastomes[J]. Shuying Zhu,Zhitao Niu,Qingyun Xue,Hui Wang,Xuezhu Xie,Xiaoyu Ding.  Acta Pharmaceutica Sinica B. 2018(06)



本文编号：3689948