苗药八爪金龙基原植物DNA条型码的筛选与鉴定

发布时间：2023-04-29 22:37

　　八爪金龙属紫金牛科(Myrsinaceae)紫金牛属(Ardisia)植物,是常用民族药,其抗病毒、抗心律失常、抗肿瘤的效果显著。八爪金龙的基原植物表型极度相似,导致其应用混乱。本研究筛选适用于八爪金龙基原植物鉴定的DNA条形码序列,以探索高效准确鉴定八爪金龙基原植物的新方法。提取了百两金、朱砂根和红凉伞的植物基因组DNA,利用DNA条形码序列(ITS, ITS2, RbcL, PsbA-trnH)对其进行PCR扩增和测序,比较各序列的扩增率和测序率,应用Blast方法来评估各序列的鉴定效率。同时与9种紫金牛属植物的相应序列进行比对,构建NJ树。结果表明:ITS、ITS2、RbcL序列的扩增成功率和测序成功率均为100%,PsbA-trnH序列的扩增成功率和测序成功率分别为97.7%和96.7%。4个候选序列的BLAST成功率结果:ITS=ITS2 (100%)>PsbA-trnH (99.2%)>RbcL (33.3%)。ITS序列的平均种间遗传距离大于平均种内遗传距离。系统发育树构建结果显示,ITS2序列的NJ树可将百两金、朱砂根和红凉伞单聚成一支,与同属植物区别开;P...

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【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 四种候选DNA条形码序列的初评估
    1.2 四条候选序列的遗传距离分析
    1.3 八爪金龙的RbcL序列数据分析
    1.4 八爪金龙的ITS2序列数据分析
    1.5 八爪金龙的PsbA-trnH序列数据分析
    1.6 八爪金龙的ITS序列数据分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 试验材料
    3.2 八爪金龙的DNA提取、扩增
    3.2 PCR产物的电泳及测序、数据处理



本文编号：3805880