基于ITS2条形码及其二级结构的菊科药用植物的系统发育分析

发布时间：2024-06-23 11:06

　　目的采用ITS2(Internal transcribed spacer2,内转录间隔区2)序列作为条形码技术对菊科药用植物进行鉴别。方法选取来自西藏自治区及四川康定、乐山和峨眉地区的菊科样品44种,提取DNA并对其进行PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链式反应)扩增,后测序,测序结果提交至GenBank;同时从GenBank上下载17条样本序列。使用MEGA7.0软件计算所提交和下载的61条序列的种内与种间遗传距离,采用邻接法(neighbor-joinging,NJ)构建系统聚类树直观反应鉴定结果。从ITS2数据库中预测并比较样本ITS2序列的二级结构差异。结果菊科植物种间最小遗传距离0.031大于种内最大遗传距离0.009,有较明显的barcoding gap;NJ树显示种各属样本分别聚为一大枝,种内之间各自聚成小支,表现出良好的单系性;各属及各种样品ITS2二级结构存在明显差异。结论以ITS2序列作为DNA条形码,能够对菊科药用植物进行准确、迅速的识别与鉴定,是物种间进化关系准确的分子鉴定依据,可为该科植物的分布、种群及种群数量的研究提供指导,为...

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料
2 方法
    2.1 样品DNA提取、PCR扩增及测序
    2.2 数据处理
3 结果
    3.1 序列长度及种内、种间K2P遗传距离分析
    3.2 NJ树分析
    3.3 ITS2二级结构的分析
4 讨论



本文编号：3995373