枇杷EjWRKY15基因克隆与蛋白特性分析

发布时间：2021-08-31 02:01

　　【目的】克隆枇杷EjWRKY15基因并对其组织表达模式及蛋白特性进行分析。【方法】从枇杷转录组数据库中获得EjWRKY15基因ORF序列,克隆该基因,对获得的基因序列进行遗传进化分析,并通过qRT-PCR探究其在不同组织中的表达模式。同时对EjWRKY15蛋白分子的理化特性、磷酸化位点、跨膜区、信号肽、亲疏水性、二级结构、三级结构和亚细胞定位等蛋白特性进行预测分析。【结果】枇杷EjWRKY15基因含有开放阅读框951 bp,共编码316个氨基酸,具有WRKY家族典型结构特征。系统进化结果表明,EjWRKY15序列与苹果WRKY61序列同源度高达95%,说明从进化角度来看,EjWRKY15与苹果WRKY61的亲缘关系最为密切。实时荧光定量PCR分析结果显示,该基因具有组织表达特异性,在根中相对表达量较高,果实次之;对EjWRKY15蛋白进行理化性质测定,其分子质量为35.79 kDa,等电点为5.09,脂溶指数为56.45,不稳定性指数为69.72,平均亲水性为-0.598,为亲水性蛋白。该蛋白含有33个磷酸化位点,包含丝氨酸（Ser）、苏氨酸（Thr）和酪氨酸（Try）,数量分别为25... 

【文章来源】：果树学报. 2020,37(12)北大核心CSCD

【文章页数】：10 页

【部分图文】：

Ej WRKY15基因克隆及结构域A.EjWRKY15基因ORF克隆；M.Magic Ruler IV;EjW15.ORF克隆；B.EjWRKY15基因结构域。

枇杷Ej WRKY15基因不同组织表达模式

蛋白二级结构预测结果显示，Ej WRKY15蛋白的二级结构主要包括α螺旋、延伸链、α转角和无规卷曲4种类型，主要以α螺旋和无规则卷曲为主，比例分别为30.70%、56.65%，其次为延伸链8.27%、β转角4.43%（图5);Ej WRKY15蛋白的三级结构分析表明，其结构域主要由4个β-折叠组成，依次为β-折叠1(WRKYGQK）、β-折叠2(RSYYKC）、β-折叠3(GVRKHVER）、β-折叠4(AVVTTY）（图6）。2.5 Ej WRKY15蛋白信号肽及跨膜结构域分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]植物抗逆相关蛋白激酶的结构与功能[J]. 杨乐,齐妍,刘生祥,张双喜,李连城,陈明,徐兆师,马有志.  植物遗传资源学报. 2013(04)



本文编号：3373948