甜瓜实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选

发布时间：2021-09-04 07:48

　　【目的】筛选可分别在甜瓜不同组织器官和不同胁迫处理下稳定表达的内参基因,用于对靶基因表达量的实时荧光定量分析,保证相关试验的准确性及可靠性。【方法】以甜瓜品种新银辉为试验材料,通过实时荧光定量PCR技术分析18s rRNA、TUA、EF1a、Actin1、Actin2、Actin3、Actin4、CYC和UBI-ep共9个候选内参基因在甜瓜不同组织器官及不同胁迫处理下的表达稳定性,包括甜瓜根、叶、种子和果实4种不同组织材料,以及水分胁迫、肉桂酸胁迫、盐碱胁迫和ABA胁迫4种处理。同时使用Best-Keeper、Norm Finder和ge Norm软件对9个候选内参基因进行稳定性分析。【结果】对不同组织器官而言,Best-Keeper评估排名前5的内参基因依次为CYC> 18s rRNA>UBI-ep>EF1a>TUA;Norm Finder计算排名前5的内参基因依次为EF1a>UBI-ep>Actin4>CYC>Actin3;ge Norm分析排名前5的基因依次为Actin4=Actin3>Actin1>EF1a>UB... 

【文章来源】：福建农业学报. 2020,35(11)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【参考文献】：
期刊论文
[1]药用蒲公英低温和高温胁迫下内参基因筛选与相关基因表达分析[J]. 乔永刚,王勇飞,曹亚萍,贺嘉欣,贾孟君,李政,张鑫瑞,宋芸.  园艺学报. 2020(06)
[2]核桃不定根发生阶段内参基因筛选与关键基因表达分析[J]. 宋晓波,常英英,刘昊,徐慧敏,裴东.  园艺学报. 2019(10)
[3]剑麻内参基因筛选与稳定表达分析[J]. 张燕梅,王瑞芳,杨子平,鹿志伟,李俊峰,赵艳龙,陆军迎,周文钊.  热带作物学报. 2019(11)
[4]不同光质条件下刺葡萄红色愈伤组织的RT-qPCR内参基因筛选[J]. 潘红,赖呈纯,张静,黄贤贵,林玉玲,赖钟雄.  应用与环境生物学报. 2019(06)
[5]黄山栾树实时荧光定量PCR内参基因的筛选[J]. 吕运舟,董筱昀,黄利斌.  分子植物育种. 2019(02)
[6]夜香树花期荧光定量PCR内参基因的筛选[J]. 刘涛,熊青,许颖妍,蔡韡韡,吕恃衡,佘文琴,陈桂信.  植物科学学报. 2017(04)
[7]羊草不同组织实时定量PCR内参基因的筛选[J]. 胡宁宁,郭慧琴,李西良,孔令琪,武自念,张继泽,常春,万东莉,臧辉,任卫波.  草业科学. 2017(07)
[8]珙桐实时定量PCR内参基因的筛选及稳定性评价[J]. 任锐,戴鹏辉,李萌,刘志明,曹福祥.  植物生理学报. 2016(10)
[9]石蒜属植物实时荧光定量PCR内参基因的选择[J]. 蒋婷婷,高燕会,童再康.  园艺学报. 2015(06)
[10]牡丹实时定量PCR分析中内参基因的选择[J]. 王彦杰,董丽,张超,王晓庆.  农业生物技术学报. 2012(05)

硕士论文
[1]甜瓜生长发育和胁迫条件下实时荧光定量PCR内参基因的筛选[D]. 史兴青.河南农业大学 2016
[2]蒙古冰草干旱胁迫下内参基因的筛选及P5CS基因定量表达分析[D]. 黄文华.内蒙古农业大学 2014



本文编号：3382875