枇杷有色体特异番茄红素β-环化酶基因的克隆及表达分析
发布时间：2021-12-11 21:53
为了解枇杷有色体特异番茄红素β-环化酶基因（CYC-B）的序列及表达特点,本研究以‘大五星’（红肉）和‘川农1-5-9’（白肉）枇杷为材料,采用同源克隆法,从枇杷果实中克隆了类胡萝卜素生物合成途径中关键酶基因之一（CYC-B的c DNA全长序列）,运用生物学软件对该序列及推导的氨基酸序列进行相关生物信息学分析,同时利用荧光定量PCR技术探究CYC-B基因在枇杷果实不同发育时期的表达模式。结果显示,该基因全长1 579 bp,具有1 491 bp的完整开放阅读框,编码496个氨基酸。氨基酸同源性分析表明,该基因编码的氨基酸序列与白梨（XP009377819.1）和苹果（Malus domestica） CYC-B基因（XP008361015.1）的同源性分别高达98%和97%,由此推测这个基因属于枇杷CYC-B基因（EjCYC-B）。荧光定量PCR分析结果表明,随着枇杷果实的发育,EjCYC-B的表达量明显增加,且不同发育阶段EjCYC-B基因的表达存在显著变化;其中,在果皮和果肉中的表达分别在黄熟期和成熟期达到最高峰。因此可以推测,EjCYC...
【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(11)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
植物CYC-B氨基酸序列系统进化树
参考张玲等(2013)的分类方法，根据花后枇杷果实的生长以及果皮着色变化，将枇杷分为未转色期、转色期、褪绿期、黄熟期和成熟期五个不同发育阶段(图6)，并将果实分为果皮、果肉后经液氮速冻后于-80℃超低温冰箱保存备用。3.2.1 枇杷总RNA的提取及c DNA的克隆
根据蛋白理化性质分析结果显示，该蛋白分子量为56.24 k D，理论等电点为8.81，带正电荷(Arg+Lys)及带负电荷(Asp+Glu)的残基总数分别为60、53，不稳定系数(Instability index)为50.26，属不稳定蛋白。亲水性/疏水性分析结果表明，该蛋白最大亲水性氨基酸值分别位于多肽链5号、228号及230号位，为-2.822；最大疏水性氨基酸值位于多肽链461号位，为2.444。该蛋白的总平均亲水性(GRAVY)为-0.181。因此，它属于亲水性蛋白。图2‘大五星’和‘川农1-5-9’枇杷CYC-B基因氨基酸序列比对
【参考文献】：
期刊论文
[1]枇杷果实类胡萝卜素研究进展[J]. 刘小洪,孙海艳,陈薇薇,郭启高,李晓林,梁国鲁. 果树学报. 2016(07)
[2]Characterization of Carotenoid Accumulation and Carotenogenic Gene Expression During Fruit Development in Yellow and White Loquat Fruit[J]. ZHANG Ling,ZHANG Zhike,ZHENG Tingting,WEI Weilin,ZHU Yunmei,GAO Yongshun,YANG Xianghui,LIN Shunquan. Horticultural Plant Journal. 2016(01)
[3]园艺植物中类胡萝卜素合成与调控的研究进展[J]. 高慧君,明家琪,张雅娟,徐娟. 园艺学报. 2015(09)
[4]枇杷果实成熟过程中果肉细胞质体的发育与果肉颜色的变化[J]. 郑婷婷,魏伟淋,何业华,杨向晖,林顺权. 果树学报. 2015(04)
[5]枇杷DXR基因的克隆及其在果实成熟过程中的表达分析[J]. 张玲,林顺权,胡又厘,郑婷婷,杨向晖. 果树学报. 2013(04)
[6]植物类胡萝卜素生物合成相关基因的表达调控及其在植物基因工程中的应用[J]. 王玉萍,刘庆昌,翟红. 分子植物育种. 2006(01)
[7]枇杷的营养及功能成分研究进展[J]. 张玉,王建清. 食品科学. 2005(09)
博士论文
[1]红肉和白肉枇杷果实类胡萝卜素差异积累机制研究[D]. 傅秀敏.浙江大学 2013
本文编号：3535464
【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(11)北大核心CSCD
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
植物CYC-B氨基酸序列系统进化树
参考张玲等(2013)的分类方法，根据花后枇杷果实的生长以及果皮着色变化，将枇杷分为未转色期、转色期、褪绿期、黄熟期和成熟期五个不同发育阶段(图6)，并将果实分为果皮、果肉后经液氮速冻后于-80℃超低温冰箱保存备用。3.2.1 枇杷总RNA的提取及c DNA的克隆
根据蛋白理化性质分析结果显示，该蛋白分子量为56.24 k D，理论等电点为8.81，带正电荷(Arg+Lys)及带负电荷(Asp+Glu)的残基总数分别为60、53，不稳定系数(Instability index)为50.26，属不稳定蛋白。亲水性/疏水性分析结果表明，该蛋白最大亲水性氨基酸值分别位于多肽链5号、228号及230号位，为-2.822；最大疏水性氨基酸值位于多肽链461号位，为2.444。该蛋白的总平均亲水性(GRAVY)为-0.181。因此，它属于亲水性蛋白。图2‘大五星’和‘川农1-5-9’枇杷CYC-B基因氨基酸序列比对
【参考文献】：
期刊论文
[1]枇杷果实类胡萝卜素研究进展[J]. 刘小洪,孙海艳,陈薇薇,郭启高,李晓林,梁国鲁. 果树学报. 2016(07)
[2]Characterization of Carotenoid Accumulation and Carotenogenic Gene Expression During Fruit Development in Yellow and White Loquat Fruit[J]. ZHANG Ling,ZHANG Zhike,ZHENG Tingting,WEI Weilin,ZHU Yunmei,GAO Yongshun,YANG Xianghui,LIN Shunquan. Horticultural Plant Journal. 2016(01)
[3]园艺植物中类胡萝卜素合成与调控的研究进展[J]. 高慧君,明家琪,张雅娟,徐娟. 园艺学报. 2015(09)
[4]枇杷果实成熟过程中果肉细胞质体的发育与果肉颜色的变化[J]. 郑婷婷,魏伟淋,何业华,杨向晖,林顺权. 果树学报. 2015(04)
[5]枇杷DXR基因的克隆及其在果实成熟过程中的表达分析[J]. 张玲,林顺权,胡又厘,郑婷婷,杨向晖. 果树学报. 2013(04)
[6]植物类胡萝卜素生物合成相关基因的表达调控及其在植物基因工程中的应用[J]. 王玉萍,刘庆昌,翟红. 分子植物育种. 2006(01)
[7]枇杷的营养及功能成分研究进展[J]. 张玉,王建清. 食品科学. 2005(09)
博士论文
[1]红肉和白肉枇杷果实类胡萝卜素差异积累机制研究[D]. 傅秀敏.浙江大学 2013
本文编号：3535464
本文链接：https://www.wllwen.com/wenshubaike/xszy/3535464.html
