芒果胶孢炭疽病菌应答菌丝机械损伤产生无性孢子的分子机制

发布时间：2022-07-29 20:59

　　胶孢炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides）是引发芒果（Mangifera indica）炭疽病的主要病原体。室内平板培养胶孢炭疽菌不产生或产生很少分生孢子的情况时有发生,但菌丝在机械损伤后24–48小时会产生大量分生孢子。胶孢炭疽菌应答机械损伤诱导产孢的核心基因及关键代谢通路尚未见报道。基于转录组测序（RNA-seq）技术检测了芒果胶孢炭疽菌菌丝在机械损伤处理后2小时内5个时间点的基因表达变化,对差异表达基因进行GO富集和KEGG代谢通路富集分析,并对菌丝响应胁迫的基因动态表达数据进行分析。基于常微分方程ODE模型结合变量选择技术,构建了动态基因调控网络。结果表明,有417个差异表达基因参与应答胶孢炭疽菌菌丝机械损伤,分属12个聚类模块,有4条通路存在显著富集,分别是丙酮酸代谢、硫代谢、黄曲霉素合成途径和二萜合成途径。结合功能注释筛选出12个应答菌丝损伤胁迫的核心基因。研究结果为后续深入开展芒果胶孢炭疽菌产孢和致病机理研究奠定了重要基础。 

【文章页数】：13 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 供试菌株
    1.2 机械损伤处理菌丝转录组样品制备方法
    1.3 RNA提取及高通量测序文库构建
    1.4 序列分析及注释
    1.5 差异基因筛选与功能富集分析
    1.6 聚类分析
    1.7 调控网络构建
    1.8 实时荧光定量PCR分析
    1.9 数据分析
2 结果与讨论
    2.1 测序结果和统计
    2.2 差异基因筛选与富集
    2.3 基因表达模式解析
    2.4 聚类模块的生物学富集
    2.5 胁迫响应基因调控网络
    2.6 应答损伤胁迫基因的动态表达模式验证
    2.7 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]The chemical treatments combined with antagonistic yeast control anthracnose and maintain the quality of postharvest mango fruit[J]. SHAO Yuan-zhi,ZENG Jiao-ke,TANG Hong,ZHOU Yi,LI Wen.  Journal of Integrative Agriculture. 2019(05)
[2]草莓胶孢炭疽菌CFEM候选效应子的生物信息学鉴定及其侵染过程中的转录分析[J]. 张丽勍,段可,邹小花,何成勇,高清华.  植物保护. 2017(05)
[3]新蚜虫疠霉菌丝和孢子阶段的转录组学分析[J]. 章树桃,陈春,解廷娜.  农业生物技术学报. 2017(09)
[4]芒果采后生理及贮藏保鲜技术研究进展[J]. 吴振麟.  安徽农学通报(上半月刊). 2011(19)
[5]NaHCO3胁迫下星星草根中Ca2+与Ca2+-ATPase的超微细胞化学定位[J]. 范玲玲,陈刚,陈义芳,周卫东,戴绍军,孙国荣.  植物学报. 2010(03)
[6]芒果采后生理生化的变化[J]. 邹日娥.  福建果树. 1995(02)

博士论文
[1]柱花草胶孢炭疽菌基因组、转录组测序及致病相关基因CgALS分析研究[D]. 黄华平.海南大学 2016
[2]盐胁迫下胡杨的生理响应及miRNA表达动态变化[D]. 周韬.北京林业大学 2014

硕士论文
[1]芒果胶孢炭疽病菌遗传转化体系的建立[D]. 李伟.华南热带农业大学 2004



本文编号：3667174