魏可葡萄气生根发育的转录组分析

发布时间：2022-09-27 12:50

　　葡萄气生根是在高温高湿环境下老蔓上发育形成的一种特殊根系类型,发育程度较低,具有分化潜力。通过技术手段诱导魏可葡萄当年生结果枝茎节处萌发气生根,以同一结果母枝未处理茎节为对照进行根系转录基因表达情况分析,结果表明,诱导气生根发育过程中有3 989个基因表达量上升,2 830个基因表达量下调。采用GO功能分类,可将注释的基因划分为40个功能类别,包括催化活性、结合和代谢过程等。部分根系关键基因表达结果表明,生长素、赤霉素、脱落酸在内的所有植物激素都参与了调控过程,结合生长素下游相应基因分析,内切葡聚糖酶基因、PRE基因和高亲和力硝酸盐转运体基因在气生根发育过程中显著上调表达,表明降解茎节处表皮细胞壁、利用硝酸盐在茎节处富集刺激根芽萌发是气生根生长发育调控机理之一。 

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料准备
    1.2 试验方法
        1.2.1 RNA提取及处理
        1.2.2 文库构建及测序
        1.2.3 转录组数据组装及基因功能注释
2 结果与分析
    2.1 葡萄根系转录组数据组装
    2.2 参考基因组对比
    2.3 可变剪切分析
    2.4 基因表达分析
    2.5 基因功能注释
    2.6 差异基因KEGG富集分析
    2.7 生长素响应基因分析
    2.8 脱落酸代谢调控
    2.9 高表达基因分析
3 讨论与结论


【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3681092