桃YABBY转录因子家族的生物信息学分析

发布时间：2022-10-30 09:49

　　为了解桃中YABBY家族的成员和特征,本研究基于桃（Prunus persica）最新基因组组装注释数据,首次通过生物信息学手段系统鉴定并分析了YABBY基因家族特征,包括染色体定位、蛋白特征、基因结构、进化关系、保守结构域、启动子区域顺式元件。结果显示:桃中含有6个YABBY基因,分布在5条染色体上,其推导蛋白序列较短,分子量较小。家族成员含有4～6个内含子,结构较为复杂。桃中YABBY基因含有植物YABBY家族所有5个亚类,即CRC、INO、FIL/YAB3、YAB2和YAB5,且均含有保守的锌指结构和YABBY结构域。除了核心启动元件,桃YABBY基因还含有大量光应答、激素响应等顺式作用元件,表明该家族基因的表达可能会受到环境、激素等的影响。本研究初步研究了桃基因组中YABBY基因家族的特征,为后期该基因家族在桃中的功能验证提供了理论支撑。 

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 数据来源
    1.2 桃YABBY基因的鉴定及分析
2 结果与分析
    2.1 桃YABBY家族成员的鉴定及蛋白特征
    2.2 桃YABBY家族基因结构分析
    2.3 桃YABBY基因家族的系统进化特征
    2.4 桃YABBY基因在染色体上的分布特征
    2.5 桃YABBY基因启动子顺势作用元件预测
3 讨论



本文编号：3698664