外源脱落酸处理的干旱胁迫下山桃叶片的转录组差异表达分析

发布时间：2023-12-24 15:32

　　以一年生实生山桃苗为试材,通过正常培养、干旱胁迫以及干旱胁迫下外施脱落酸(ABA)的山桃叶片进行高通量转录组测序分析,探究山桃响应干旱胁迫的分子机制,筛选响应ABA处理的功能基因。结果表明:试验共构建9个文库进行转录组测序。转录组测序共获得67.14 Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到5.81 Gb,Q30碱基百分比在91.71%及以上。与对照相比,干旱处理组差异表达基因显著上调596个,下调1 025个。与干旱处理组相比,干旱+ABA处理组差异表达基因显著上调394个,下调117个。GO富集分析表明:对照组、干旱处理组和干旱+ABA处理组在生物学途径中富集最多的类别都是代谢过程;在细胞组件和分子功能中, 3个不同处理组富集最多的基因类别均是细胞组分和催化活性相关的基因。KEGG富集分析表明:与对照相比,干旱处理组的样本有260个差异表达基因参与72条代谢途径;与干旱处理组相比,干旱+ABA处理组的样本有66个差异表达基因参与了38条代谢途径。经KEGG显著性富集分析,筛选到淀粉和蔗糖代谢、植物激素信号转导等相关基因。采用实时荧光定量PCR对筛选到的基因进行了...

【文章页数】：12 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 山桃总RNA的提取及c DNA的合成
    1.3 质量文库的评估
    1.4 差异基因筛选
    1.5 差异表达基因的功能注释与富集分析
    1.6 差异表达基因荧光定量PCR分析
2 实验结果
    2.1 测序数据质量分析
    2.2 样本基因的注释和差异表达基因的筛选分析
    2.3 差异表达基因的Gene Ontology富集分析
    2.4 差异表达基因的KEGG注释
    2.5 关键基因的差异表达分析
3 讨论



本文编号：3874794