葡萄Alfin-like转录因子家族的鉴定和表达分析

发布时间：2024-02-26 20:27

　　Alfin-like (AL)转录因子家族对高盐、低温、干旱等非生物胁迫反应具有重要的调控作用。该研究采用同源比对的方法检索鉴定葡萄AL转录因子家族基因、分析其生物信息学特性,并采用qRT-PCR方法分析非生物胁迫下AL基因的表达特征,以探究葡萄AL基因在非生物逆境胁迫中的功能。结果表明:(1)在葡萄中共鉴定出6个AL基因家族成员,分别命名为VvAL1～VvAL6,且6个成员分别分布在6条染色体上。(2)葡萄中AL转录因子具有高度保守的DUF3594结构域和PHD结构域,各家族成员均含有5个外显子和4个内含子;上游启动子区域分析发现大量植物激素与非生物胁迫响应相关的顺式作用元件。(3)基因芯片表达模式分析显示,盐、干旱、ABA胁迫以及低温(5℃)处理均显著影响葡萄AL家族基因(VvAL1～VvAL6)的表达。(4)qRT-PCR检测显示,不同胁迫处理下AL基因在葡萄叶片中的表达水平不同;ABA处理下葡萄AL转录因子家族基因表达量较对照均显著下调,但在PEG处理下差异不显著;在盐胁迫处理下,VvAL2、VvAL4、VvAL5基因的表达量均显著上调,分别是对照的23倍、8.5倍和10.5倍...

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【部分图文】：

图2葡萄中AL家族基因的结构域分析

利用AL基因家族成员单独构建的进化树、外显子-内含子结构及保守基序信息绘制图谱(图4),在图4,a中,AL基因家族单独构建的进化树与之前一致。图4,b由GSDS在线分析,葡萄AL家族各基因均含有5个外显子和4个内含子,基因结构相似,基因结构完整。通过MEME软件在葡萄AL家族基....

图4葡萄AL家族基因结构和保守基序分析

图7葡萄AL基因家族在不同处理下的

图5葡萄AL基因启动子区域的顺式作用元件分布

图4葡萄AL家族基因结构和保守基序分析图6葡萄AL基因家族基因芯片表达分析

图6葡萄AL基因家族基因芯片表达分析

图5葡萄AL基因启动子区域的顺式作用元件分布2.6.2葡萄AL转录因子家族应答ABA胁迫表达模式

本文编号：3911813