海南省百岁老人队列的建立与长寿相关肠道宏基因组学研究

发布时间：2021-04-26 20:39

　　目的通过建立海南省百岁老人随访队列并分析其肠道菌群结构变化,揭示百岁老人由健康状态至死亡前的这一生命周期特定阶段的肠道菌群变化规律,探讨肠道菌群在维系百岁老人身体健康方面可能的作用及影响,以及肠道菌群变化与死亡进程之间可能的互相影响,为长寿状态的保持提供新的思路和途径。方法1.采用前瞻性研究的方法,随机选取海南省146名健康百岁以上老人建立随访队列。对澄迈、儋州地区64名老人进行为期15个月,间隔3个月的健康状态随访,并收集粪便及血液标本直至死亡。2.通过自身对照的方法,分别对4名百岁老人临去世前6个月（Predeath6）和去世前（Death）两个时间点的肠道菌群进行宏基因组测序研究。3.利用随机森林算法建立预测模型,寻找百岁老人临去世前相关的显著差异菌作为生物标记,对百岁老人的身体衰亡状态（即:濒临去世状态）进行预测。结果1.本队列研究始于2016年8月,入组百岁老人平均年龄为105.2±3.1岁,截至本论文完成时（2018年1月）,共有15位老人达到随访终点（去世）,其平均去世年龄为105.6±2.9岁,一年期死亡率为17.2%,气候因素对生存期有影响（P<0.05）,性别... 

【文章来源】：中国人民解放军医学院北京市

【文章页数】：73 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
英文缩略词表
中文摘要
英文摘要
前言
第一部分 百岁老人队列情况
    一、实验对象
        1. 试验对象的选择
        2. 样本量估计
        3. 纳入和排除标准
        4. 研究资料收集
    二、实验样本采集及保存
        1. 粪便标本的采集
        2. 粪便标本命名
    三、结果
        1. 队列完成情况
        2. 百岁老人生存情况分析
    四、讨论
第二部分 百岁老人肠道菌群分析结果
    一、分析方法
        1. 材料
            1.1 实验试剂及耗材明细
            1.2 主要试验仪器明细
        2. 建库
        3. 生物信息分析
    二、结果及讨论
        1. 长队列百岁老人基本信息
        2. 数据质控
            2.1 原始数据统计
            2.2 单个样品的单次测序Reads各位置碱基分布与质量分布
        3. 物种注释与差异物种分析
            3.1 物种注释统计
            3.2 各水平物种丰度表
            3.3 单样品物种组成分析
            3.4 多样品物种分析
            3.5 核心物种统计分析
            3.6 物种累积曲线
            3.7 优势物种分析
            3.8 三角Ternary图
            3.9 优势物种聚类分析
            3.10 主成分分析（PCA）
            3.11 主坐标分析（PCoA）
            3.12 NMDS分析
            3.13 物种Anosim分析
            3.14 物种MRPP分析
            3.15 组内组间显著差异物种
            3.16 物种LEfSe差异分析
        4. 随机森林模型预测显著差异菌
    三、小结
    四、讨论
    五、全文总结
参考文献
文献综述
    参考文献
附录
    附表一
    附表二
攻读学位期间发表文章情况
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]中国海南百岁老人队列研究:研究设计及初步结果[J]. 何耀,栾复新,姚尧,杨姗姗,解恒革,李靖,刘淼,王建华,吴蕾,朱乔,陈小萍,宁超学,王鲁宁,李小鹰,张思兵,张福,赵亚力.  中华流行病学杂志. 2017 (09)
[2]21世纪的人口老龄化:成就与挑战[J].   人口与计划生育. 2013(01)



本文编号：3162079