欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1理化性质与结构的生物信息学分析

发布时间：2017-08-05 19:11

  本文关键词：欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1理化性质与结构的生物信息学分析

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【摘要】：目的:运用生物信息学相关软件,预测欧洲女贞花粉主要过敏原Lig v 1的理化性质和结构,为Lig v 1重组表达系统的选择和过敏原性改造提供参考。方法:查询文献获得Lig v 1的氨基酸序列,运用生物信息学软件分析其理化性质(Prot Param)、信号肽(Signal P 4.1 Server)、跨膜区(TMHMM Server v.2.0)、二级结构(GOR4)、MHCⅡ类抗原表位(Net MHCⅡ2.2 Server)、B细胞抗原表位(ProteanTM5.01)以及系统发生树(MEGA 6)。结果:Lig v 1在大肠杆菌中稳定性较好,不存在信号肽与跨膜区;二级结构中无规则卷曲占大多数;Lig v 1潜在MHCⅡ类抗原表位为30~44区域;B细胞抗原表位既具有连续的氨基酸序列,也具有不连续的氨基酸序列;Lig v 1与欧洲白蜡以及木犀榄的同源蛋白进化距离最近。结论:大肠杆菌是适合重组Lig v 1的表达系统,Lig v 1抗原表位分析为低过敏原性改造提供参考。
【作者单位】： 中山大学生命科学学院/有害生物控制与资源利用国家重点实验室;呼吸疾病国家重点实验室变态反应研究室/变态反应国家临床重点专科/广东省过敏反应与免疫重点实验室/广州医科大学附属第二医院;
【关键词】： 欧洲女贞 过敏原 生物信息学软件 Lig v 抗原表位
【基金】：国家重大科技专项(2014ZX0801105B)
【分类号】：R392;Q811.4
【正文快照】： 1本文为国家重大科技专项(2014ZX0801105B)。2呼吸疾病国家重点实验室变态反应研究室/变态反应国家临床重点专科/广东省过敏反应与免疫重点实验室/广州医科大学附属第二医院,广州510260。过敏性疾病是当今世界性的重大卫生学问题。世界变态反应组织对30个国家过敏性疾病流行病，

本文编号：626474