戈登菌mmpL3同源基因序列分析及功能预测

发布时间：2017-08-15 06:19

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【摘要】：目的分析支气管戈登菌临床株mmpL3(Rv0206c)同源基因(Gbro4481)序列,并预测其蛋白质结构及功能,为Gbro4481蛋白的进一步研究奠定基础。方法根据全基因组测序结果和同源比对找到支气管戈登菌的mmpL3同源基因,应用expasy工具预测支气管戈登菌MmpL3同源蛋白理化性质;利用Interproscan和Gene ontology工具对蛋白保守序列和功能进行预测;使用TMHMM在线工具进行拓扑结构预测。结果筛选出MmpL3同源蛋白(Gbro4481),该蛋白含有2个膜转运蛋白结构域和1个固醇敏感多肽区;TMHMM预测Gbro4481蛋白有10个跨膜区。结论支气管戈登菌的Gbro4481蛋白与结核分枝杆菌H37Rv的mmpL3蛋白同源,是分枝菌酸的转运蛋白,参与胞内小分子的运输和信号转导。
【作者单位】： 武汉轻工大学生物与制药工程学院;上海公共卫生临床中心;上海交通大学医学院免疫与微生物学系;
【关键词】： 支气管戈登菌 mmpL同源基因 生物信息学分析
【基金】：武汉轻工大学研究生创新基金项目(No.2014cx019)
【分类号】：R378.91
【正文快照】： ***戈登菌与分枝杆菌同属于抗酸染色阳性菌,且能引起疑似结核病的肺部感染,易误诊为结核病,且对抗结核药多耐药。近年来,武汉地区致病性戈登菌的感染呈逐渐上升的趋势[1]。MmpL蛋白为分枝杆菌特有的一类蛋白,其中mmpL3基因编码的膜蛋白参与分枝杆菌胞壁分枝菌酸的代谢,影响细

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