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基于转录组测序的马尔尼菲青霉菌实时荧光定量PCR内参基因筛选与鉴定

发布时间:2017-08-16 14:12

  本文关键词:基于转录组测序的马尔尼菲青霉菌实时荧光定量PCR内参基因筛选与鉴定


  更多相关文章: 马尔尼菲青霉菌 内参基因 实时荧光定量PCR DigA基因 FacpA基因


【摘要】:马尔尼菲青霉菌是一种温度依赖性双相型条件致病真菌,可感染免疫缺陷人群,区域流行于东南亚地和我国南方,但其双相转换和致病性分子机制尚不清楚。实时荧光定量PCR是马尔尼菲青霉菌双相转换和致病性分子机制研究的重要手段,但仍缺乏用于马尔尼菲青霉菌实时荧光定量PCR标准化分析理想的内参基因。本研究根据转录组测序数据筛选了四个表达最稳定的Pfp、Rp123、FacpA、DigA基因与传统的内参基因18Sr RNA、β-actin(Act1)、β-tubulin(Btu)作为候选内参基因,用Best Keeper和ge Norm软件进行基因表达稳定性分析。结果表明FacpA和DigA基因在马尔尼菲青霉菌双相转换过程中表达最为稳定,可作为用于马尔尼菲青霉菌实时荧光定量PCR标准化分析的内参基因。
【作者单位】: 广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室;广西医科大学基础医学中心实验室;广西高校基础医学研究重点实验室;广西高校生物分子医学研究重点实验室;广西医科大学基础医学院微生物学教研室;广西医科大学第一附属医院呼吸科;
【关键词】马尔尼菲青霉菌 内参基因 实时荧光定量PCR DigA基因 FacpA基因
【基金】:国家自然科学基金项目(No.81160195)资助
【分类号】:R379
【正文快照】: 马尔尼菲青霉(Penicillium marneffei,PM)是马尔尼菲青霉病(Penicilliosis marneffei,PSM)的病原菌,是青霉属中唯一的温度依赖性双相型真菌和机会性致病菌,在25℃时呈菌丝相,产生无性繁殖的分生孢子,37℃培养或感染人体后转化为致病性酵母相,通过有丝分裂繁殖,区域性流行于东

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本文编号:683712

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