幽门螺杆菌hp0521基因编码蛋白的生物信息学分析

发布时间：2017-08-18 16:40

  本文关键词：幽门螺杆菌hp0521基因编码蛋白的生物信息学分析

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【摘要】：目的:对4株幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)中hp0521基因编码的细胞毒素相关基因2(cytotoxin-associated gene 2,Cag2)蛋白从生物信息学角度进行基本理化性质、信号肽及功能的预测分析。方法:用PCR技术克隆测序获得4株Hp菌株的hp0521基因序列,生物信息学工具分析其编码Cag2蛋白的基本理化性质、有无信号肽及蛋白指纹图谱。结果:成功克隆测序4株Hp菌株的hp0521基因序列,提交基因库后获得相应登录号;hp0521基因编码的Cag2蛋白氨基酸数目和相对分子质量大小不同,理论等电点偏碱性,为稳定亲水性蛋白,不存在信号肽;Cag2蛋白指纹图谱分析存在DNA拓扑异构酶Ⅰ、IL-3细胞因子、抗增殖蛋白BTG1家族、介导细胞壁延伸的蛋白、卤酸脱卤酶/环氧水解酶、调节染色体凝集功能RCC1家族等蛋白标签。结论:Hp中hp0521基因编码的Cag2蛋白可能介导细胞壁延伸和调节染色体凝集,参与致病信号通路的传导,可能具有DNA拓扑异构酶Ⅰ、卤酸脱卤酶/环氧水解酶等相应酶活性。
【作者单位】： 江苏大学医学院;
【关键词】： 幽门螺杆菌 cag致病岛 hp 生物信息学
【基金】：国家自然科学基金资助项目(81271795) 高等学校博士学科点专项科研基金(博导类)资助项目(20123227110008)
【分类号】：Q811.4;R378
【正文快照】： 高致病性的幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)携带cag致病岛(cag pathogenicity island,cag PAI),其编码组装的Ⅳ型分泌系统将细胞毒素相关基因A蛋白(cytotoxin-associated gene A,Ca-g A)、肽聚糖等致病因子注入宿主细胞内,引起胃组织高分泌IL-8,导致慢性浅表性胃炎等临床

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