抑制消减杂交技术在筛选矽肺大鼠差异表达基因中的应用

发布时间：2020-02-09 00:00

【摘要】：目的对正常大鼠肺组织与矽肺大鼠肺组织之间基因表达差异进行比较,筛选与矽肺相关的差异表达基因片段。方法 30只SD大鼠随机分为2个组,对照组6只,实验组24只。实验组大鼠采用非气管暴露法染尘制作矽肺大鼠模型,对照组灌注生理盐水,利用HE切片确定建立模型成功;抑制消减杂交技术构建cDNA双向消减文库;菌液RCR技术初步筛选cDNA消减文库,将获得的阳性克隆进行测序、同源性比对及生物信息学分析。结果扩增消减cDNA文库获得400多个白色阳性克隆,随机挑取252个白色克隆用PCR进行扩增,95%的克隆中均有100~1 500bp的插入片段,经测序,得到具有差异表达的基因175个。经生物信息学分析表明,筛选出的已知差异表达基因与众多生物学过程和分子功能相关,包括物质代谢、物质转运、细胞增殖、细胞凋亡、细胞黏附、信号转导等,其中许多差异表达基因与矽肺的关系尚未被报道。结论利用抑制消减杂交技术可以建立高质量的矽肺正、反向差异消减cDNA文库,筛选与矽肺相关的已知和未知基因,为寻找矽肺诊断和预后的检查指标和筛选治疗靶点提供有用的信息。

【参考文献】

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1 李杰平;何平平;于小华;张书杰;张平;;大鼠肺纤维化细胞凋亡及Cathepsin B基因变化的关系[J];现代生物医学进展;2007年05期

2 陈原稼，陈元方，马雪梅，尹珊珊，陆国钧，，王宝恩;血管活性肠肽受体在大鼠肝脏贮脂细胞的表达及其在肝纤维化中的意义[J];胃肠病学和肝病学杂志;1996年04期

3 唐胜建,王小柯,陈建华,王雪耘,梁伟中,梁晓琴;无瘢痕愈合中核糖体蛋白s29基因表达产物对皮肤成纤维细胞增生的作用[J];中国临床康复;2004年23期

4 姜莉,陈佰义,侯显明;肺纤维化大鼠细胞外基质蛋白的变化[J];中国医科大学学报;1998年01期

【共引文献】

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1 郭超荣,邹杰,王晓红,邱绍勤,何健;结核病患者血清中细胞外基质成分的检测及分析[J];广西预防医学;2000年03期

2 张永珍;李文芳;樊新生;马小华;吴绪敏;张传森;;同步诱导培养兔骨髓源性内皮祖细胞和平滑肌祖细胞[J];第二军医大学学报;2014年01期

3 周六化;杨斌;夏佳东;王鹏基;陈峗;戴玉田;;CM-DiI标记兔外周血平滑肌祖细胞可行性分析[J];南京大学学报(自然科学);2014年01期

4 张诚;林中;袁园;段泽辉;;重症急性胰腺炎大鼠胃窦肌间血管活性肠肽神经元的变化[J];医学研究生学报;2014年09期

5 赵勤萍;王洋;薛晓明;关炜;;抗纤益肺胶囊对肺纤维化大鼠肺组织病理变化及纤维4项的影响[J];山西中医;2012年07期

6 姚岚;盛丽;王莉;李东书;马智;;沙参对肺纤维化大鼠FN、LN的影响[J];中国工业医学杂志;2007年02期

7 孙晓芳;段斐;刘佳琳;牛建昭;吴素焕;;三七总皂苷对肺纤维化小鼠组织蛋白酶B表达的影响[J];时珍国医国药;2013年05期

8 栾永福;孙蓉;;基于“温补脾阳”功效的附子“效—毒—证”关联研究[J];世界中医药;2014年02期

9 曹芝君,莫剑忠;肠血管活性肽及其受体与肝脏疾病[J];胃肠病学;1999年03期

10 史丽娜;郭明;;扶正减毒颗粒对急性放射性肺损伤小鼠肺病理学改变及LN的影响[J];现代中医药;2010年06期

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2 孙晓芳;三七总皂苷防治博莱霉素诱导小鼠肺纤维化的实验研究[D];北京中医药大学;2011年

3 蒋宁;保肺方对肺间质纤维化大鼠模型细胞外基质代谢影响的实验研究[D];北京中医药大学;2003年

4 熊良庚;肝硬化与胆囊及VIP、CCK之间关系的初步探讨[D];重庆医科大学;2004年

5 盛丽;水蛭抗肺纤维化作用及其机制的研究[D];辽宁中医药大学;2006年

6 殷茜;肺微血管内皮细胞功能表型变化与博莱霉素大鼠肺纤维化相关性研究[D];第四军医大学;2009年

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3 华文敏;自噬/cathepins激活机制在姜黄素抗内皮细胞缺血再灌注损伤中的作用[D];苏州大学;2009年

4 胡迎春;铀矿尘致大鼠肺组织纤维化的相关机制研究[D];南华大学;2010年

5 胡月媛;JNK信号通路对大鼠肺纤维化Ⅰ型胶原的影响[D];山西医科大学;2012年

6 孙富强;瑞舒伐他汀及PCI对循环内皮祖细胞的影响[D];天津医科大学;2013年

7 毛雨红;CXCR4/CXCR7在SDF-1诱导间充质干细胞增殖、迁移中的作用及信号转导机制研究[D];桂林医学院;2013年

8 田继康;肝素寡糖与血管活性肠肽抗菌活性结构域相互作用的初步研究[D];山东大学;2014年

【二级参考文献】

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1 周柔丽;纤维粘连蛋白和层粘连蛋白与疾病[J];基础医学与临床;1992年06期

2 姜莉，陈佰义，侯显明;肺纤维化大鼠纤维连接蛋白的动态变化及秋水仙碱的抑制作用[J];中国医科大学学报;1995年04期

3 孔璐,王继峰,牛建昭;特发性肺纤维化与细胞凋亡[J];中华结核和呼吸杂志;2004年06期

4 李今朝,李艳杰,李振华,康健,侯显明,于润江;实验性肺纤维化细胞凋亡及Fas/FasL基因变化[J];中华结核和呼吸杂志;2005年03期

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1 郑敏;探寻差异表达基因的方法进展[J];国外医学(流行病学传染病学分册);2002年01期

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3 杨谊,周保和,邱宗荫,刘淑红,范明;点燃大鼠脑内差异表达基因的筛选和分析[J];重庆医学;1998年05期

4 赵勇,丁金凤;寻找差异表达基因[J];国外医学.遗传学分册;2000年02期

5 蔡绍曦;赵海金;丁彦青;李文军;周斌;肖军;;哮喘发作与细胞骨架重建相关基因的差异表达[J];第四军医大学学报;2006年24期

6 吕立夏,徐磊,杨翠香,李学礼,王尧;单眼视网膜摘除鸽视盖差异表达基因的筛选[J];解剖学报;2002年05期

7 范保星,张开泰,孙敬芬,项小琼,谢玲,胡迎春,王升启,吴德昌;BEP2D细胞恶性转化不同时期差异表达基因的筛选[J];中华放射医学与防护杂志;2003年04期

8 彭依群,廖二元,邓小戈;雌二醇诱导人成骨样细胞差异表达基因筛查[J];中华内科杂志;2003年08期

9 王学,徐静;一种鉴别基因差异表达的新方法——差异表达mRNA呈现技术[J];生物工程进展;1998年03期

10 金慧英,房德兴;检测差异表达基因技术的研究进展[J];免疫学杂志;2000年S1期

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1 胡建达;陈晓梨;陈鑫基;祝亮方;杨月玲;陈元仲;吕联煌;;抑制性消减杂交法研究初治和复发急性淋巴细胞白血病基因的差异表达[A];第九届全国实验血液学会议论文摘要汇编[C];2003年

2 狄冉;储明星;;高通量筛选差异表达基因技术简介[A];中国畜牧兽医学会养羊学分会全国养羊生产与学术研讨会议论文集[C];2010年

3 叶波平;边杉;赵艳景;王颖;奚涛;王;吴梧桐;;鲨鱼再生肝组织中差异表达基因及其产物的活性研究[A];中国海洋生化学术会议论文荟萃集[C];2005年

4 朱金金;刘桂琼;王志跃;杨海明;;应用mRNA差异显示技术研究鸡贮精腺差异表达基因[A];中国家禽业——机遇与挑战——第十三次全国家禽学术讨论会论文集[C];2007年

5 秦国政;田世平;王清;刘嘉;;线粒体蛋白差异表达及氧化修饰与果实成熟衰老的关系[A];第三届全国植物蛋白质组学大会摘要集[C];2010年

6 慕开达;朱云霞;张蓉;胡承;王从容;王琛;贾伟平;;基于NOS1AP基因SNP分型的人肝脏全基因组差异表达研究[A];中华医学会糖尿病学分会第十六次全国学术会议论文集[C];2012年

7 毛兴学;庄楚雄;彭新湘;梅曼彤;郭振飞;李明启;;水稻冷相关基因的克隆及差异表达[A];全国植物光合作用、光生物学及其相关的分子生物学学术研讨会论文摘要汇编[C];2001年

8 任绪义;张建鹏;冯伟华;焦炳华;;大鼠睾丸镉毒性相关蛋白差异表达分析[A];中国蛋白质组学第二届学术大会论文摘要论文集[C];2004年

9 胡志昂;王洪新;;杂交水稻光抑制差异表达基因的克隆及其遗传来源[A];2006年中国植物逆境生理生态与分子生物学学术研讨会论文摘要汇编[C];2006年

10 康丽;姜运良;;用cDNA-AFLP筛选鸡卵巢性成熟差异表达基因[A];中国家禽科学研究进展——第十四次全国家禽科学学术讨论会论文集[C];2009年

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1 ;肾癌差异表达基因鉴定及功能研究[N];中国医药报;2002年

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2 彭依群;雌二醇诱导人成骨样MG-63细胞差异表达基因的分离和鉴定[D];中南大学;2003年

3 陈赛娟;不同被毛密度獭兔皮肤组织的差异表达基因筛选和CCNA2基因的多态性检测及其与被毛密度的相关性研究[D];河北农业大学;2011年

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