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NRAMP1基因、维生素D受体基因多态性与中国藏族结核病的关联研究

发布时间:2020-05-08 21:54
【摘要】: 目的:研究自然抗性相关巨噬细胞蛋白1(natural-resistance-associatedmacrophage protein 1,NRAMPl)基因4种多态现象与藏族结核病易感性的关系。 方法:选取藏族活动性肺结核患者140例,感染结核菌未发病的同民族对照139例,用变性高效液相色谱(DHPLC)检测和聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析的方法对NRAMP1基因4种多态性(5′(GT)n、INT4、D53N、3′UTR)进行基因分型,根据不同基因型与单倍型对样本进行分组,最后经统计学处理,研究4种多态性及其单倍型与肺结核易感性的关系。 结果:病例组中,(GT)_9/(GT)_9、(GT)_9/(GT)_(10)、(GT)_(10)/(GT)10多态性(GT)_9/(GT)_9、(GT)_9/(GT)_(10)、(GT)_(10)/(GT)_(10)三种基因型分别为63例(45%)、58例(41.4%)、19例(13.6%);而对照组的相应基因型为88例(63.3%)、41例(29.5%)、10例(7.2%),病例组(GT)_(10)/(GT)_(10)基因型频率明显高于对照组(p<0.01,OR 2.654,95%可信区间1.156,6.094)。病例组中INT4多态性G/G,G/C 2种基因型分别为127例(90.7%)、13例(9.3%);而对照组的相应基因型则为133例(95.7%)、6例(4.3%),两组的基因型频率无显著性差异(p>0.05,OR 2.269,95%可信区间0.837,6.152)。病例组中3′UTR多态性TGTG+/+、TGTG/缺失、TGTG缺失/缺失三种基因型分别为84例(60.0%)、50例(35.7%)、6例(4.3%);对照组的相应基因型为101例(72.7%)、36例(25.9%)、2例(1.4%),病例组TGTG+/缺失基因型频率与对照组比较无显著性差异(p>0.05,OR 2.027,95%可信区间1.182,3.476)。病例组中G/G,G/A 2种基因型分别为103例(73.6%)、37例(26.4%);对照组的相应基因型则为118例(84.9%)、21例(15.1%)。病例组G/A基因型频率显著高于对照组(p<0.05,OR 2.018,95%可信区间1.111,3.668)。 5′(GT)_n与INT4 D′为0.859,存在连锁不平衡;3′UTR与D543ND′为0.821,存在连锁不平衡;其余等位基因间未见连锁不平衡(D′<0.5)。 在病例组,5′(GT)_9/INT4 C、5′(GT)_(10)/INT4 C、5′(GT)_9/INT4 G与5′(GT)_(10)/INT4 G单倍型频率分别为0.9%、3.7%、64.8%、30.6%;在对照组,上述单倍型频率为0%、2.2%、78.1%、19.8%。病例组的5′(GT)_9/INT4 G单倍型频率显著低于对照(p<0.01,OR 0.51795%可信区间0.355,0.752)。病例组中,3′UTR TGTG/D543N A、3’UTRTGTG/D543N G、3’UTR TGTG缺失1D543N A、3’UTR TGTG缺失1D543N A单倍型频率分别为1.2%、76.6%、12.0%、10.1%,在对照组中,上述单倍型频率为1.2%、84.4%、6.4%、8.0%。病例组3’UTR TGTG/D543N G单倍型频率较对照显著降低(p<0.05,OR 0.605,95%可信区间0.395,0.927),3’UTR TGTG缺失1/D543N A单倍型较对照显著增加(p<0.05,OR 2.003,95%可信区间1.098,3.653)。 结论:NRAMP1基因中5′(GT)_n、D53N多态性与肺结核易感性相关,未发现INT4多态性、3′UTR与肺结核发病有关联。3′UTR与D543N、5′(GT)_n与INT4分别存在连锁不平衡。5′(GT)_9/INT4 G单倍型、YUTR TGTG/D543N G与肺结核抵抗性有关,3'UTR TGTG缺失1/D543N A单倍型与肺结核敏感性有关。 目的:研究基因维生素D受体基因2种多态现象与藏族结核病易感性的关系。 方法:选取藏族活动性肺结核患者140例,有分枝杆菌接触史的同民族健康对照139例,用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析的方法对NRAMP1基因2种多态性(FokⅠ、taqⅠ)进行基因分型,根据不同基因型与单倍型对样本分组,经统计学处理,研究2种多态性与肺结核易感性的关系。 结果:病例组中,FF、Ff与ff 3种基因型分别为60例(42.9%)、56例(40%)、24例(17.1%);而健康对照组的相应基因型为70例(50.4%)、60例(43.2%)、9例(6.5%),病例组ff基因型频率显著高于对照(p<0.05,OR 3.111,95%可信区间1.343,7.207))。病例组中TT、Tt 2种基因型分别为137例(97.9%)、3例(2.1%);而健康对照组的相应基因型则为134例(96.4%)、5例(3.6%)。通过X~2检验表明,两组的基因型频率无显著性差异(p>0.05,OR 1.704,,95%可信区间0.399,7,272)。FokⅠ与TaqⅠ二位点D′为0.475,不存在连锁不平衡。 结论:维生素D受体基因中FokⅠ多态性与肺结核易感性有关,未见TaqⅠ多态性与肺结核发病的关联。FokⅠ多态性与TaqⅠ多态性之问不存在连锁不平衡。
【图文】:

NRAMP1基因、维生素D受体基因多态性与中国藏族结核病的关联研究


NRAMPI基因3‘UTR与D543N多态性PCR产物

NRAMP1基因、维生素D受体基因多态性与中国藏族结核病的关联研究


5‘(GT)n微卫星多态性麟岭标洗协创司(Inm),纫申力表示DNA在2,Inm的吸收度;创剖鱿砌伪肩峰
【学位授予单位】:四川大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:R521;R450

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本文编号:2655101

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