NRAMP1及MBL SNPs与宁夏海原回族肺结核病遗传易感性的关联性研究

发布时间：2020-08-12 09:02

【摘要】： 目的结核病的发生是结核分枝杆菌与宿主之间相互作用的结果,宿主遗传因素在结核病发生发展过程中有着不可忽视的作用。本研究选择的结核病主要候选易感基因:自然抗性相关性巨噬细胞蛋白1(NRAMP1)基因甘露聚糖结合凝集素( MBL)基因,探讨其多态性与宁夏海原地区人群结核病遗传易感性的相关性。方法采用以医院为基础的病例对照研究设计。收集2007年3月-2008年3月,经宁夏海原县医院确诊的回族结核病患者141例,另选择与其相匹配的152例回族健康人群作为对照(均排除结核病史,且无自身免疫病、慢性炎症等其他疾病),应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法检测3’UTR、D543N及MBL-G54A多态性位点的基因型,采用SPSS11.5统计软件进行统计学分析,计算基因型频率,等位基因频率及比值比(OR)。结果(1)对病例和对照人群中的3个基因多态性位点的频率进行检验,均符合Hardy-Weinberg平衡定律,表明各基因型频率在该人群中已达遗传平衡,所选样本具有群体代表性。(2)以NRAMP1-3’UTR位点TGTG+/+基因型为参照,NRAMP1-3’UTR位点TGTG+/del基因型在病例组中的分布频率显著高于对照组(P值分别为0.006;OR值为1.562),差异具有显著性意义;NRAMP1-3’UTR位点TGTGdel/del基因型在病例组和对照组中的分布差异无显著性意义(P值为0.774;OR值为0.854)。(3)以NRAMP1- D543N位点GG基因型为参照组,NRAMP1- D543N位点GA基因型在病例组中的分布频率显著高于对照组(P值为0.012;OR值为1.545),差异具有显著性意义;NRAMP1- D543N位点AA基因型在病例组和对照组中的分布差异无显著性意义(P值分别为0.186;OR值为1.781)。(4)以MBL-G54A位点的GG基因型为参照组,MBL-G54A位点GA基因型在病例组的分布频率显著高于对照组(P值为0.008;OR值为1.572);MBL-G54A位点AA基因型在病例组和对照组中的分布差异无显著性意义(P值分别为0.991;OR值为0.994)。结论(1) NRAMP1-3’UTR位点TGTG+/del基因型可能与宁夏海原回族肺结核的易感性相关。(2)NRAMP1-D543N位点GA基因型可能与宁夏海原回族肺结核的易感性相关。(3)MBL-G54A位点GA基因型可能与宁夏海原回族肺结核的易感性相关。
【学位授予单位】：宁夏医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2009
【分类号】：R521
【图文】：

纯合子,多态性,缺失突变,参照物

图 1 NRAMP1-3’UTR PCR 扩增产物Fig1 PCR Production of NRAMP1-3’UTRMarker 500/400/300/250/200/50Lane1-7 PCR 扩增产物（244bp）P1-3’UTR 多态性分型结果R-RFLP 法确定 NRAMP1-3’UTR 多态性，在该基因多态生 TGTG 缺失突变会使其内部原有的 FokⅠ酶切位点酶解成不同的片段。电泳后在 DNA 标准分子量参照物型，即 TGTG+/+纯合子（211bp、33bp）；TGTG+/del 杂p）；TGTGdel/del 纯合子（240bp）（如图 2）。

基因分型,位点,纯合子,杂合子

图 2 NRAMP1-3’UTR 位点基因分型结果Fig2 Genotypes of NRAMP1-3’UTRMarker 500/400/300/200/180/160/140/120/100/80/60/40/20 bLane 2,4,5,8 TGTG+/+纯合子（211bp,33bp）Lane 1,7,9 TGTG+/del 杂合子（240bp,211bp,33bp）Lane 3,6,10 TGTGdel/del 纯合子（240bp）序结果序结果（反向测序）与分型结果完全一致（图 3a，图 3b），说靠的基因分型。

位点多态性,步骤,体系,产物

n(frequency)77(54.6%)n(frequency)104(68.4%) 59(41.9%) 40(26.3%) 7.452 0.006 1.5(3.5%) 8(5.3%) 0.083 0.774 0.213(75.5%)69(24.5%)248(81.6%)56(18.4%) 3.188 0.0741.543N 位点多态性分析标本DNA 按照材料和方法所述的步骤及体系进 4 所示，PCR 产物为 244bp。

【参考文献】