基于生物信息学分析哮喘患者鼻黏膜上皮细胞DNA及α肌动蛋白2甲基化差异性表达

发布时间：2021-04-11 22:10

　　目的:研究哮喘患者鼻黏膜上皮细胞中全基因组甲基化水平及α肌动蛋白2（actin alpha 2,ACTA2）基因启动子区域甲基化水平改变。方法:利用甲基化850K芯片法检测6例哮喘患者与5例健康者鼻黏膜上皮细胞中全基因组甲基化水平,进行生物功能分析后选择ACTA2为目的基因,以重亚硫酸盐测序法检测12例哮喘患者及12例健康者ACTA2启动子区域甲基化水平。结果:850K芯片测序结果显示,哮喘患者所有常染色体均存在不同程度的甲基化修饰,大部分发生在基因体及基因间区,10%～20%发生在启动子区,且高甲基化和低甲基化改变可存在于同一染色体上;重亚硫酸盐法测序示与健康对照组相比,哮喘组ACTA2基因启动子区出现明显高甲基化改变（P=0.001）。结论:哮喘患者鼻黏膜上皮细胞各染色体均出现广泛甲基化修饰,ACTA2基因启动子区域出现高甲基化改变。 

【文章来源】：江苏大学学报(医学版). 2020,30(04)

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【部分图文】：

差异性甲基化位点总体比例

本研究中检测所得的差异性甲基化区域绝大多数集中在基因体及基因间区，位于启动子区域的差异性甲基化位点占10%～20%，分布比例如图2所示。2.1.4 GO分析

本研究中所涉及的GO功能分析包括三个方面:生物学过程、细胞组分、分子功能。哮喘患者鼻黏膜上皮细胞中相关的甲基化差异显著区域的GO富集结果分析如图3所示，其中包括了平滑肌细胞增殖及上皮管腔形成等各个方面。AC-TA2基因与其中的血管平滑肌收缩、蛋白质磷酸化的正向调控、信号传感器的活动及线粒体功能等方面相关。2.2 ACTA2启动子检测分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]利用补丁甲基化技术构建特殊报告载体检测DNA甲基化对FCER1G基因启动子的调控活性[J]. 梁云生,赵明,梁功平,尹恒,陆前进.  中南大学学报(医学版). 2013(02)



本文编号：3132047