肺结核分子流行病学研究
本文关键词：肺结核分子流行病学研究，由笔耕文化传播整理发布。
【摘要】：目的：本研究旨在寻找肺结核的遗传易感位点，探索宿主遗传因素差异对肺结核发病的影响，为肺结核的预防和药物研发提供理论依据。 方法：1、对1218名汉族居民进行病例对照研究，其中病例组600例，对照组618例。进行流行病学调查和生化指标检查。用血液基因组DNA提取试剂盒提取DNA。运用限制性片段长度多态性聚合酶链反应（restriction fragment length polymorphism polymerasechain reaction，PCR-RFLP）技术检测CISH基因rs2239751和rs622502的基因多态性，探索CISH基因与中国汉族人群肺结核的关联性。 2、验证肺结核GWAS中rs2057178和rs4331426在中国汉族人群中是否与肺结核相关。运用Pub med、Embase、中国生物医学文献、中国知网和万方数据库，系统检索2000年到2014年3月1日之间发表的研究rs2057178多态性或rs4331426多态性与肺结核关系的中英文文献，采用Stata version11.0软件进行Meta分析。 结果：1、病例组平均年龄41.03±16.26岁；对照组平均年龄43.26±17.26岁。差异无统计学意义，P0.05。病例组痰样本涂片阳性率为29.7%。胸片X线异常率为99.0%。卡介苗接种率31.2%。 2、CISH基因的rs2239751和rs622502等位基因分布均符合Hardy-Weinberg（H-W）遗传平衡定律，表明抽样方法可靠，研究样本的群体代表性较好。 3、rs4331426和rs2057178等位基因分布均符合Hardy-Weinberg（H-W）遗传平衡定律，表明抽样方法可靠，研究样本的群体代表性较好。 4、CISH基因rs2239751位点多态性与肺结核相关性研究中，rs2239751位点基因型和等位基因分布在两组间差异有统计学意义，P值分别为0.02和0.01，并且携带C等位基因个体患肺结核的风险是携带A等位基因的个体1.16倍（OR95%CI=1.03-1.29，P=0.01）。 5、CISH基因rs622502位点多态性与肺结核相关性研究中，rs622502位点基因型和等位基因分布在两组间差异均无统计学意义，P0.05。 6、验证肺结核GWAS中rs4331426位点在汉族人群中是否与肺结核相关研究中，rs4331426基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义，P0.05。对基因分型结果按性别，年龄和涂片情况进行分层，仍然显示rs4331426基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义，P0.05。 7、验证肺结核GWAS中rs2057178位点在汉族人群中是否与肺结核相关研究中，rs2057178基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义，P0.05。对基因分型结果按性别，年龄和涂片情况进行分层，仍然显示rs2057178基因型频率在病例组和对照组中差异无统计学意义，P0.05。 8、rs4331426的Meta分析包括研究对象16325人，其中病例组6176人，对照组10149人。病例组和对照组中G等位基因的频率分别为36.8%和34.0%。非洲组的异质性检验无统计学意义，因此选用Peto Mantel-Haenszel method固定效应模型进行数据合并计算OR；亚洲组和总体的异质性差异有统计学意义，P0.1，因此选用Dersimonian Lairdmethod随机效应模型进行数据合并计算OR值。Meta分析结果显示rs4331426在非洲人群中研究的合并OR值为1.18，95%CI为1.11-1.25；亚洲人群研究的合并OR值为0.85，95%CI为0.59-1.23；总体合并OR值为1.12，95%CI为1.02-1.23。显著性检验Z值为4.84，P㩳0.0001，差异具有统计学意义。漏斗图和Egger’s-test结果显示此次Meta分析存在发表偏倚的可能性较小。 9、rs2057178的Meta分析包括研究对象23897人，，其中病例组9421人，对照组14476人。病例组和对照组中T等位基因的频率分别为15.6%和18.2%。各研究间的异质性检验无统计学意义，因此选用Peto Mantel-Haenszel method固定效应模型计算合并OR值。Meta分析结果显示rs2057178合并OR值为1.21，95%CI为1.15-1.28。显著性检验Z值为6.90，P㩳0.0001，差异具有统计学意义。漏斗图和Egger’s-test结果显示此次Meta分析存在发表偏倚的可能性较小。 结论：1、在汉族人群中rs2239751位点多态性可能是肺结核的危险因素之一。rs622502位点多态性可能与肺结核无关。 2、在汉族人群中，经验证rs2057178和rs4331426位点多态性可能与肺结核无关。即使排除性别，年龄和涂片情况等混杂因素，rs2057178和rs4331426位点多态性可能与肺结核无关。 3、rs4331426在非洲人群中可能是肺结核的易感位点，携带G等位基因比携带A等位基因患肺结核的风险高；在亚洲人群中rs4331426可能并非肺结核的易感位点。 4、rs2057178在非洲人群中可能是肺结核的一个易感位点。携带T等位基因比携带C等位基因患肺结核的风险高。
【关键词】：肺结核 CISH 基因 多态性 全基因组关联研究
【学位授予单位】：宁波大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：R521
【目录】：
- 摘要4-7
- Abstract7-10
- 缩略语表10-13
- 引言13-15
- 第一部分 CISH 基因多态性与肺结核的关联研究15-27
- 引言15-16
- 1 研究目的16
- 2 材料与研究方法16-22
- 2.1 材料16-17
- 2.1.1 仪器16
- 2.1.2 试剂16-17
- 2.1.3 耗材17
- 2.2 研究方法17-22
- 2.2.1 确定研究对象17
- 2.2.2 流行病学调查及生化指标检查17-18
- 2.2.3 血样采集18
- 2.2.4 血液 DNA 提取18
- 2.2.5 DNA 浓度测定及标化18-19
- 2.2.6 PCR-PFLP 检测基因多态性19-22
- 2.2.7 统计分析22
- 3 结果22-25
- 3.1 一般资料和生化指标比较22
- 3.2 RS2239751 和 RS622502 酶切结果分析判定22-23
- 3.3 两组 H-W 检验及基因型频率比较23-24
- 3.4 两组基因频率比较及风险性分析24-25
- 3.5 不同人群中 RS2239751 和 RS622502 与肺结核的相关性25
- 4 讨论25-27
- 第二部分 肺结核 GWAS 的验证及相关基因多态性与肺结核发病率关联的 Meta 分析27-49
- 引言27
- 1 研究目的27-28
- 2 研究步骤28-47
- 2.1 在中国汉族人群中验证肺结核 GWAS28-35
- 2.1.1 材料与方法28-32
- 2.1.2 统计分析32
- 2.1.3 结果32-35
- 2.2 META 分析35-47
- 2.2.1 研究方法36-37
- 2.2.2 结果37-47
- 3 讨论47-49
- 参考文献49-54
- 附录 A 综述54-66
- 参考文献60-66
- 在学研究成果66-67
- 致谢67
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 何玉龙;张文清;吴月红;;一氧化氮在结核分支杆菌感染巨噬细胞中的作用研究进展[J];动物医学进展;2014年07期
中国博士学位论文全文数据库 前9条
1 巴恒星;中国梅花鹿全基因组初步组装、分析及单核苷酸多态性研究[D];中国农业科学院;2012年
2 韩宏志;HDACs基因家族基因多态性与精神分裂症的关联性分析[D];吉林大学;2012年
3 胡耀东;鸡H/L和SRBC遗传选择及部分抗病性状全基因组关联分析[D];四川农业大学;2012年
4 陈英敏;初中生羞怯的结构、特点及遗传与环境的影响作用[D];山东师范大学;2013年
5 尚军亮;全基因组单核苷酸多态性交互作用研究[D];西安电子科技大学;2013年
6 谢岩;奶牛产奶性状候选基因EEF1D和PDE9A功能验证[D];中国农业大学;2013年
7 范松华;SLC7A7基因与胶质瘤易感性及胶质母细胞瘤患者预后关系的研究[D];苏州大学;2013年
8 杨健康;中国汉族人群重型痤疮的全基因组关联研究[D];云南大学;2014年
9 何萍;染色体15q25.1区域基因多态性与中国南方人群肺腺癌易感性的关联研究[D];南方医科大学;2014年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 尚贤金;染色体12p13两基因间多态与脑梗死的关联研究[D];福建医科大学;2011年
2 逯越;反流性食管炎的流行特征及遗传易感性分析[D];郑州大学;2011年
3 李兴川;61781例家族性和散发食管癌临床病理和生存期及与PLCE1和RFT2基因多态相关性[D];郑州大学;2011年
4 伍s
本文编号：315891
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/huxijib/315891.html
