海南汉族、黎族人群基因多态性与慢性阻塞性肺疾病遗传易感性的关联研究

发布时间：2017-09-15 09:30

  本文关键词：海南汉族、黎族人群基因多态性与慢性阻塞性肺疾病遗传易感性的关联研究

  更多相关文章： 慢性阻塞性肺疾病 海南黎族 海南汉族 病例-对照研究 遗传易感性

【摘要】：目的：慢性阻塞性肺疾病(Chronic obstructive pulmonary disease COPD)是一种呼吸系统疾病。个体遗传易感因素影响COPD的发生风险。本研究旨在了解海南地区黎族与汉族人群慢性阻塞性肺疾病患病与多个COPD候选基因的多态性之间否具有关联性,从而找出影响COPD发生的风险基因,为研究COPD的发病机制提供相关理论依据。方法：我们采用了病例对照研究,收集2012-2014在海南省人民医院诊断为COPD的患者480例,其中黎族234例,汉族246例。健康对照组590例黎族240例,汉族350例。利用MassArray分型技术对34个单核苷酸多态性(SNP)位点进行分型,并采用卡方检验和各种遗传模型分析评估这些SNP与慢性阻塞性肺病的关联性。结果：1.卡方分析结果发现rs7671167(FAM13A),rs950063(MIR2054), rs17050782(SETD7),rs652520(ATF1P1,),rs1923539(SFTPD),rs17157266(AHNAK), rs667282(CHRNA5),rs8048576(ATP2C2),rs7937(EGLN2)这9个SNP位点黎族汉族人群中基因分布频率有较大差异(p0.05)。2.遗传模型结果表明：位于SETD7基因上的rs17050782位点(odds ratio[OR]=1.40,95%confidence interval[CI]=1.07-1.83,p= 0.017),CHRNA5基因上的rs667282位点(OR=1.36,95%CI=1.05-1.76,p=0.029), ATP2C2基因上的rs8048576(OR=0.68,95%CI=0.52-0.88,p=0.004)位点与海南黎族人群的慢性阻塞性肺疾病显著相关。在汉族人群中发现了三个位点与COPD显著相关分别为RNF150 rs10007052(OR=1.48,95%CI=1.12-1.98,p.0.008)；TMEM173 rs13181561 (OR=0.74,95%CI=0.58-0.94,p=0.018)；ZBTB9 rs9296092,(OR=2.54,95%CI= 1.26-5.24,p=0.014)；。3.利用分层分析检验吸烟组和非吸烟组组别间风险等位基因的效用差异。发现rs2301113(HIF1A)(P interaction=0.0074),rs13180(IREB2)(P interaction=0.012)这两个位点吸烟和多态性之间存在着交互作用。结论：本研究结果表明,黎族和汉族人群发现了CHRNA5,FAM13A,IREB2, HIF1A,RNF150,SETD7等多个基因上的易感基因位点。尽管我们的结果需要大样本数据进行验证,但是这些结果对于COPD的发病机制提供了一些新的见解。
【关键词】：慢性阻塞性肺疾病 海南黎族 海南汉族 病例-对照研究 遗传易感性
【学位授予单位】：西北大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R563.9
【目录】：

• 摘要3-4
• Abstract4-9
• 第一章 引言9-14
• 1.1 慢性阻塞性肺疾病研究现状9-10
• 1.2 SNP概述10-11
• 1.3 全基因组关联分析及与慢性阻塞性肺疾病的关系11-14
• 第二章 实验材料与方法14-24
• 2.1 材料14-15
• 2.1.1 主要实验仪器14
• 2.1.2 主要试剂及其溶液配制14-15
• 2.2 研究对象15-17
• 2.2.1 慢性阻塞性肺疾病组15-16
• 2.2.2 健康对照组16-17
• 2.3 血液采集与DNA提取17-18
• 2.4 SNP位点的选择策略与方法18
• 2.5 引物的设计与合成18
• 2.6 SNP分型18-21
• 2.6.1 分型原理18-19
• 2.6.2 MassArray基因分型步骤19-21
• 2.7 统计分析21-24
• 2.7.1 数据整理21
• 2.7.2 均衡性检验21
• 2.7.3 位点/样本过滤21
• 2.7.4 频数/频率统计21-22
• 2.7.5 卡方检验22
• 2.7.6 Hardy-Weinberg平衡22
• 2.7.7 关联分析22-24
• 第三章 实验及分析结果24-46
• 3.1 Massarray分型结果24-25
• 3.2 研究对象的基本信息25-26
• 3.3 黎族汉族人群显著性差异分析26-29
• 3.4 SNP与慢性阻塞性肺疾病的关联分析29-46
• 3.4.1 海南黎族,汉族人群候选基因位点的基本信息29-34
• 3.4.2 遗传模型分析结果34-40
• 3.4.3 黎族与汉族单倍体型分析40-43
• 3.4.4 吸烟与COPD的多态性研究43-46
• 第四章 讨论46-52
• 结论52-53
• 参考文献53-61
• 附录61-63
• 攻读硕士学位期间取得的学术成果63-64
• 致谢64

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 刘玉华;郑小文;黄娇平;赖小惠;;东莞市T2DM患者与健康人ACE基因多态性研究[J];临床心身疾病杂志;2006年05期

2 罗晓秋;潘尚领;刘承武;;转化生长因子-β基因多态性和人类衰老[J];医学综述;2007年06期

3 李立青;田亚平;;基因多态性与战士训练安全[J];解放军医学杂志;2008年03期

4 马力通;李s，

本文编号：855689