α-L-岩藻糖甘酶1基因在小鼠不同组织中的表达分析
发布时间:2021-04-18 03:59
为了研究不同组织中α-L-岩藻糖苷酶1 (α-L-fucosidase1, FUCA1)特异性表达的调节机制,运用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR, qPCR)和蛋白免疫印迹(Western Blot)在mRNA水平和蛋白水平上分析了Fuca1基因在小鼠成体不同组织中的表达特点,还利用Clustal Omega分析了氨基酸序列在不同物种的同源性和系统进化树。qPCR检测结果显示,Fuca1基因在小鼠不同组织中存在表达差异,在睾丸中表达最高,其次是肾脏与卵巢;而Western Blot检测结果显示FUCA1主要在小鼠肾脏和卵巢高表达;对FUCA1氨基酸序列进行同源性分析,结果显示FUCA1保守性低。以上研究表明,FUCA1可能与小鼠的组织特异性表达调节有关,其在性腺中的具体表达机制还有待研究。
【文章来源】:湖南师范大学自然科学学报. 2020,43(02)北大核心
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
Fuca1基因在小鼠各组织的mRNA表达分析
FUCA1在小鼠各组织的蛋白表达分析
本研究发现,在mRNA水平上,FUCA1在睾丸中表达最高,在肌肉和肝脏最低;免疫印迹技术则证实了FUCA1在小鼠8个组织都有广泛的表达,而且最高表达出现在肾脏而不是睾丸,脾脏和肌肉中出现最低表达,有趣的是,与其相应的mRNA上表达比较,可以发现并非呈线性关系。根据以前中心法则,DNA编码序列被转录为mRNA,然后被翻译为蛋白质。尽管蛋白质的合成及降解的速率均发生变化,但蛋白质的丰度取决于其mRNA的丰度。此过程涉及许多调控,大量研究报告认为,两者之间的相关性通常较低[17-19]。JAX实验室研究人员测量来自192个多样性近交系小鼠的肝脏中的全基因组转录本和蛋白质表达,推测定量性状位点(quantitative trait locus, QTL)是靶基因附近的遗传变异,会影响其表达,可能QTL会顺式作用并影响转录本和蛋白质水平,远端的QTL对靶基因在反式中的表达发挥作用[20]。人们已经在酵母和植物中研究了蛋白质和转录水平的一致性,但Anatole等[21]进行小鼠比较研究表明,转录物和蛋白质的水平仅与约一半的测试基因显著相关,平均相关系数为0.27。蛋白质和转录本之间的关系可能部分能用分子事件来解释,如翻译效率、选择性剪接、折叠、组装成复合物;转运和定位、共价修饰、分泌和降解等都会影响蛋白质水平,而且与转录本无关。本文结果中睾丸组织的转录本和蛋白水平表达不一致,笔者推测是该基因翻译过程中可能接受一系列的化学修饰信号,如miRNA,使其蛋白水平下调,翻译表达后被部分降解[22,23],还可能是在翻译后受到磷酸化、硫酸化、泛素化等。图4 不同物种FUCA1系统进化树
【参考文献】:
期刊论文
[1]高脂对中华鳖肝脏组织中microRNA及相关基因表达的影响[J]. 刘丽,伍远安,李传武,邹利,蒋国民,李金龙,王晓清,李玉珑. 湖南师范大学自然科学学报. 2018(06)
[2]α-L-岩藻糖苷酶基因在斑马鱼发育过程中的功能分析[J]. 王道,刘文彬,肖亚梅. 生命科学研究. 2013(04)
[3]黄鳝α-L-岩藻糖苷酶基因克隆及其在雌雄个体间的表达分析[J]. 王道,廖高鹏,肖亚梅. 湖南师范大学自然科学学报. 2013(04)
本文编号:3144757
【文章来源】:湖南师范大学自然科学学报. 2020,43(02)北大核心
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
Fuca1基因在小鼠各组织的mRNA表达分析
FUCA1在小鼠各组织的蛋白表达分析
本研究发现,在mRNA水平上,FUCA1在睾丸中表达最高,在肌肉和肝脏最低;免疫印迹技术则证实了FUCA1在小鼠8个组织都有广泛的表达,而且最高表达出现在肾脏而不是睾丸,脾脏和肌肉中出现最低表达,有趣的是,与其相应的mRNA上表达比较,可以发现并非呈线性关系。根据以前中心法则,DNA编码序列被转录为mRNA,然后被翻译为蛋白质。尽管蛋白质的合成及降解的速率均发生变化,但蛋白质的丰度取决于其mRNA的丰度。此过程涉及许多调控,大量研究报告认为,两者之间的相关性通常较低[17-19]。JAX实验室研究人员测量来自192个多样性近交系小鼠的肝脏中的全基因组转录本和蛋白质表达,推测定量性状位点(quantitative trait locus, QTL)是靶基因附近的遗传变异,会影响其表达,可能QTL会顺式作用并影响转录本和蛋白质水平,远端的QTL对靶基因在反式中的表达发挥作用[20]。人们已经在酵母和植物中研究了蛋白质和转录水平的一致性,但Anatole等[21]进行小鼠比较研究表明,转录物和蛋白质的水平仅与约一半的测试基因显著相关,平均相关系数为0.27。蛋白质和转录本之间的关系可能部分能用分子事件来解释,如翻译效率、选择性剪接、折叠、组装成复合物;转运和定位、共价修饰、分泌和降解等都会影响蛋白质水平,而且与转录本无关。本文结果中睾丸组织的转录本和蛋白水平表达不一致,笔者推测是该基因翻译过程中可能接受一系列的化学修饰信号,如miRNA,使其蛋白水平下调,翻译表达后被部分降解[22,23],还可能是在翻译后受到磷酸化、硫酸化、泛素化等。图4 不同物种FUCA1系统进化树
【参考文献】:
期刊论文
[1]高脂对中华鳖肝脏组织中microRNA及相关基因表达的影响[J]. 刘丽,伍远安,李传武,邹利,蒋国民,李金龙,王晓清,李玉珑. 湖南师范大学自然科学学报. 2018(06)
[2]α-L-岩藻糖苷酶基因在斑马鱼发育过程中的功能分析[J]. 王道,刘文彬,肖亚梅. 生命科学研究. 2013(04)
[3]黄鳝α-L-岩藻糖苷酶基因克隆及其在雌雄个体间的表达分析[J]. 王道,廖高鹏,肖亚梅. 湖南师范大学自然科学学报. 2013(04)
本文编号:3144757
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