草原革蜱Dermacentor nuttalli中Rickettsia的检测及其对宿主遗传多样性的影响
发布时间：2021-05-11 15:56
草原革蜱（Dermacentor nuttalli）,隶属于硬蜱科（Ixodidae）,革蜱属（Dermacentor）,分布广泛,是我国北方地区的常见种,在黑龙江、吉林、内蒙古、辽宁、河北等地均有发现,同时作为多种病原体的传播媒介,威胁人类和动物的健康。Rickettsia是一类严格胞内寄生的革兰氏阴性细菌,作为脊椎动物的病原菌能够导致斑疹热等多种疾病,是重要的蜱传病原菌,在部分蜱中,Rickettsia还可以作为共生菌存在。研究Rickettsia与其宿主草原革蜱的关系,为蜱媒疾病的分布、控制及蜱类种群遗传等研究工作提供了理论基础。1、本研究通过PCR法特异性扩增Rickettsia的16S rRNA基因、ompA基因和gltA基因片段,检测四个地理种群的草原革蜱内Rickettsia的感染情况,内蒙古额尔古纳、吉林延边、黑龙江大庆、河北小五台四个地区,共检测草原革蜱样本118头。基于三个基因片段检测Rickettsia的检出率一致,感染Rickettsia的样本数量为63头,总感染率为53.39%（63/118）。其中,内蒙古地区感染率最高,为80%（24/30）。河北地区感染率...
【文章来源】：河北师范大学河北省
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 综述
1.1 草原革蜱概述
1.2 Rickettsia 概述
1.2.1 斑点热群 Rickettsia 的分布
1.2.2 Rickettsia 的检测与鉴定
1.2.3 Rickettsia 的致病机制
1.3 Rickettsia 对宿主的影响
1.4 研究目的及研究意义
2 实验材料和方法
2.1 实验材料
2.1.1 样品采集
2.1.2 实验设备
2.1.3 实验耗材
2.2 实验方法
2.2.1 草原革蜱总DNA的提取
2.2.2 Rickettsia 的检测及目的基因的扩增
2.2.3 草原革蜱种群目的基因片段的扩增
2.2.4 电泳检测
2.2.5 PCR产物纯化回收及序列测定
2.2.6 PCR产物凝胶回收及序列测定
2.2.7 数据处理及分析
3 实验结果
3.1 不同地理种群草原革蜱内 Rickettsia 的检测及鉴定
3.1.1 草原革蜱内 Rickettsia 的感染情况
3.1.2 Rickettsia 的鉴定
3.2 Rickettsia 遗传多样性分析
3.2.1 Rickettsia 单倍型多样性分析
3.2.2 Rickettsia 种群遗传多样性分析
3.2.3 Rickettsia 种群遗传结构分析
3.2.3.1 种群遗传距离
3.2.3.2 种群遗传分化系数FST值
3.2.3.3 分子变异方差分析(AMOVA)
3.2.3.4 单倍型网络图分析
3.2.3.5 系统发育树分析
3.3 Rickettsia 与草原革蜱遗传多样性的关系
3.3.1 Rickettsia 对草原革蜱种群遗传多样性的影响
3.3.1.1 草原革蜱的单倍型分布
3.3.1.2 草原革蜱遗传多样性分析
3.3.2 Rickettsia 对草原革蜱种群遗传结构的影响
3.3.2.1 种群遗传分化分析
3.3.2.2 单倍型网络图分析
3.3.2.3 系统发育分析
4 讨论
4.1 不同地理种群草原革蜱中 Rickettsia 的检测及鉴定
4.2 Rickettsia 的种群遗传多样性分析
4.3 Rickettsia 对草原革蜱的影响
5 总结与展望
参考文献
致谢
攻读学位期间取得的科研成果清单
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的洪泽湖湖鲚遗传多样性分析[J]. 李大命,张彤晴,唐晟凯,关浩勇,刘燕山,穆欢,黄越峰,潘建林. 江苏农业科学. 2018(20)
[2]浙江省中东部白纹伊蚊共生菌沃尔巴克氏体的调查研究[J]. 郭颂,凌锋,王金娜,吴瑜燕,侯娟,龚震宇. 中国媒介生物学及控制杂志. 2015(06)
[3]新发蜱传病原体——劳氏立克次体的研究现状[J]. 闻静,焦丹,鞠文东,黄玉明,王悦,王建华,时晓杰,成洪艳,程成,孙毅. 中国人兽共患病学报. 2015(04)
[4]草原革蜱和边缘革蜱的分子生物学鉴定[J]. 吕继洲,王振宝,袁向芬,吴绍强. 中国畜牧兽医. 2013(09)
[5]我国立克次体研究与立克次体病的流行现状[J]. 张丽娟,付秀萍,范明远. 热带病与寄生虫学. 2005(01)
[6]草原革蜱产卵、孵化及幼蜱蜕皮的观察[J]. 姜广仁,马立名. 华东昆虫学报. 1999(02)
硕士论文
[1]人感染新斑点热群立克次体的发现及自然疫源地调查研究[D]. 马兰.中国人民解放军军事医学科学院 2015
本文编号：3181689
【文章来源】：河北师范大学河北省
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
1 综述
1.1 草原革蜱概述
1.2 Rickettsia 概述
1.2.1 斑点热群 Rickettsia 的分布
1.2.2 Rickettsia 的检测与鉴定
1.2.3 Rickettsia 的致病机制
1.3 Rickettsia 对宿主的影响
1.4 研究目的及研究意义
2 实验材料和方法
2.1 实验材料
2.1.1 样品采集
2.1.2 实验设备
2.1.3 实验耗材
2.2 实验方法
2.2.1 草原革蜱总DNA的提取
2.2.2 Rickettsia 的检测及目的基因的扩增
2.2.3 草原革蜱种群目的基因片段的扩增
2.2.4 电泳检测
2.2.5 PCR产物纯化回收及序列测定
2.2.6 PCR产物凝胶回收及序列测定
2.2.7 数据处理及分析
3 实验结果
3.1 不同地理种群草原革蜱内 Rickettsia 的检测及鉴定
3.1.1 草原革蜱内 Rickettsia 的感染情况
3.1.2 Rickettsia 的鉴定
3.2 Rickettsia 遗传多样性分析
3.2.1 Rickettsia 单倍型多样性分析
3.2.2 Rickettsia 种群遗传多样性分析
3.2.3 Rickettsia 种群遗传结构分析
3.2.3.1 种群遗传距离
3.2.3.2 种群遗传分化系数FST值
3.2.3.3 分子变异方差分析(AMOVA)
3.2.3.4 单倍型网络图分析
3.2.3.5 系统发育树分析
3.3 Rickettsia 与草原革蜱遗传多样性的关系
3.3.1 Rickettsia 对草原革蜱种群遗传多样性的影响
3.3.1.1 草原革蜱的单倍型分布
3.3.1.2 草原革蜱遗传多样性分析
3.3.2 Rickettsia 对草原革蜱种群遗传结构的影响
3.3.2.1 种群遗传分化分析
3.3.2.2 单倍型网络图分析
3.3.2.3 系统发育分析
4 讨论
4.1 不同地理种群草原革蜱中 Rickettsia 的检测及鉴定
4.2 Rickettsia 的种群遗传多样性分析
4.3 Rickettsia 对草原革蜱的影响
5 总结与展望
参考文献
致谢
攻读学位期间取得的科研成果清单
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的洪泽湖湖鲚遗传多样性分析[J]. 李大命,张彤晴,唐晟凯,关浩勇,刘燕山,穆欢,黄越峰,潘建林. 江苏农业科学. 2018(20)
[2]浙江省中东部白纹伊蚊共生菌沃尔巴克氏体的调查研究[J]. 郭颂,凌锋,王金娜,吴瑜燕,侯娟,龚震宇. 中国媒介生物学及控制杂志. 2015(06)
[3]新发蜱传病原体——劳氏立克次体的研究现状[J]. 闻静,焦丹,鞠文东,黄玉明,王悦,王建华,时晓杰,成洪艳,程成,孙毅. 中国人兽共患病学报. 2015(04)
[4]草原革蜱和边缘革蜱的分子生物学鉴定[J]. 吕继洲,王振宝,袁向芬,吴绍强. 中国畜牧兽医. 2013(09)
[5]我国立克次体研究与立克次体病的流行现状[J]. 张丽娟,付秀萍,范明远. 热带病与寄生虫学. 2005(01)
[6]草原革蜱产卵、孵化及幼蜱蜕皮的观察[J]. 姜广仁,马立名. 华东昆虫学报. 1999(02)
硕士论文
[1]人感染新斑点热群立克次体的发现及自然疫源地调查研究[D]. 马兰.中国人民解放军军事医学科学院 2015
本文编号：3181689
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/jichuyixue/3181689.html
