长链非编码RNA lncATV参与宿主抗病毒机制的研究
发布时间：2021-08-27 17:35
天然免疫是宿主抵抗病原体入侵和清除机体内潜在威胁的重要生物学过程,是由多个宿主分子参与的动态过程。病毒感染细胞后能够快速刺激机体的天然免疫反应,诱导细胞产生包括干扰素在内的多种细胞因子的表达。干扰素主要包括Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型三种类型,它们能够诱导细胞内多种干扰素调节基因（Inteferon stimulated genes,ISG）的表达,这些ISG的编码蛋白具有抑制病毒感染、调节天然免疫等多种的功能,也有研究发现干扰素能够调节细胞内的非编码RNA,参与细胞内多种的生物学过程。长链非编码RNA（Long noncoding RNA,lncRNA）,是一类长度大于200个核苷酸的非编码RNA,lncRNA可以与DNA作用参与细胞核内染色质的形成,或者调节细胞内蛋白质或RNA的功能,但是大部分lncRNA的功能是仍然是未知的。研究细胞内干扰素调节的lncRNA表达谱变化,并进一步筛选功能性的lncRNA,有助于更深入的理解干扰素的作用机制和探索lncRNA的作用机制。本研究以三种不同类型的干扰素处理人肝癌细胞系Huh7,采用基因芯片的方法检测细胞内lncRNA的表达谱变化,筛选三种类型干扰素...
【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】：100 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１：?ＲＬＲ识别病毒ＲＮＡ并激活天然免疫反应［Ｉ３］??ＲＬＲ家族的ＲＩＧ－Ｉ、ＭＤＡ５及ＬＧＰ２识别的ＲＮＡ种类不同，在细胞内的调??
是从编码基因的内含子区域转录的，而ＮＡＴｓ则是由编码基因的负链进行转录的，??ＮＡＴｓ在细胞中是普遍存在的，在小鼠的基因组中，约有７２％的基因会转录出??ａｎｔｉｓｅｎｓｅ?ｌｎｃＲＮＡ［ＩＣ）ＣＵＣ）１］。ＩｎｃＲＮＡ的转录模式以及它在人类基因的丰度如图２，??虽然已经有部分研究鉴定了?ＩｎｃＲＮＡ的功能，但大部分的ＩｎｃＲＮＡ功能是未知的。??ＩｎｃＲＮＡ在细胞内的功能与ＩｎｃＲＮＡ的结构和在基因组上的位置有很大的相??关性，根据己有的研究，可以将ＩｎｃＲＮＡ的功能分为以下４类：参与调解染色质??的作用、影响ＲＮＡ的功能、与蛋白质之间的相互作用影响蛋白的功能以及作为??很多疾病诊断的标志物等。??（１）?ＩｎｃＲＮＡ可以顺式作用（Ｉｎ－ｃｉｓ）的方式调节染色质的形成。例如ＰＲＣ２??与?ＩｎｃＲＮＡ?ＨＯＴＡＩＲ?的?５’端结合，促使?Ｈ３Ｋ２７?的甲基化；ＬＳＤｌ／ＣｏＲＥＳＴ／ＲＥＳＴ??与ＨＯＴＡＩＲ的５’端结合，促使Ｈ３Ｋ４的去甲基化，ＨＯＴＡＩＲ通过这种作用对ＤＮＡ??２１??
８小时和２４小时的细胞样本，ＭＸＡ是干扰素处理后显著上调的ＩＳＧ，采用??ｑＲＴ－ＰＣＲ的方法检测细胞内ＭＸＡ基因的表达水平，用以确定干扰素的处理效??果，结果如图４。如图４Ａ所示，将Ｈｕｈ７细胞用ＩＦＮ－ａ２ｂ处理８小时和２４小时??时，细胞内ＭｘＡ基因的转录水平均明显上升，并且处理８小时的细胞中，ＭｘＡ??转录水平高于处理２４小时的细胞样本；如图４Ｂ、４Ｃ所示，ＩＦＮ－ｙ或ＩＦＮ４１处??理Ｈｕｈ７细胞后，ＭＸＡ的转录水平随着处理时间的延长，表达水平也逐渐升高，??并且干扰素处理８小时，对ＭＸＡ的诱导水平已经有２００倍以上。综上可知，??在Ｈｕｈ７细胞中，三种不同类型的干扰素处理细胞８小时均能显著诱导ＭＸＡ基??因转录水平升高，因此最终选择以即ＩＦＮ－ａ２ｂ?（ｌｎｇ／ｍｌ），ＩＦＮ－ｙ?（１５ｎｇ／ｍｌ）和??ＩＦＮ－Ｘ１?（２５ｎｇ／ｍｌ）的处理浓度，处理Ｈｕｈ７细胞８小时，收集的细胞样本，利??用基因芯片的方法对ｍＲＮＡ和ＩｎｃＲＮＡ表达谱进行分析。??Ａ?３００－
【参考文献】：
期刊论文
[1]Emerging complexity and new roles for the RIG-I-like receptors in innate antiviral immunity[J]. John S.Errett,Michael Gale Jr.. Virologica Sinica. 2015(03)
本文编号：3366792
【文章来源】：北京协和医学院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章页数】：100 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１：?ＲＬＲ识别病毒ＲＮＡ并激活天然免疫反应［Ｉ３］??ＲＬＲ家族的ＲＩＧ－Ｉ、ＭＤＡ５及ＬＧＰ２识别的ＲＮＡ种类不同，在细胞内的调??
是从编码基因的内含子区域转录的，而ＮＡＴｓ则是由编码基因的负链进行转录的，??ＮＡＴｓ在细胞中是普遍存在的，在小鼠的基因组中，约有７２％的基因会转录出??ａｎｔｉｓｅｎｓｅ?ｌｎｃＲＮＡ［ＩＣ）ＣＵＣ）１］。ＩｎｃＲＮＡ的转录模式以及它在人类基因的丰度如图２，??虽然已经有部分研究鉴定了?ＩｎｃＲＮＡ的功能，但大部分的ＩｎｃＲＮＡ功能是未知的。??ＩｎｃＲＮＡ在细胞内的功能与ＩｎｃＲＮＡ的结构和在基因组上的位置有很大的相??关性，根据己有的研究，可以将ＩｎｃＲＮＡ的功能分为以下４类：参与调解染色质??的作用、影响ＲＮＡ的功能、与蛋白质之间的相互作用影响蛋白的功能以及作为??很多疾病诊断的标志物等。??（１）?ＩｎｃＲＮＡ可以顺式作用（Ｉｎ－ｃｉｓ）的方式调节染色质的形成。例如ＰＲＣ２??与?ＩｎｃＲＮＡ?ＨＯＴＡＩＲ?的?５’端结合，促使?Ｈ３Ｋ２７?的甲基化；ＬＳＤｌ／ＣｏＲＥＳＴ／ＲＥＳＴ??与ＨＯＴＡＩＲ的５’端结合，促使Ｈ３Ｋ４的去甲基化，ＨＯＴＡＩＲ通过这种作用对ＤＮＡ??２１??
８小时和２４小时的细胞样本，ＭＸＡ是干扰素处理后显著上调的ＩＳＧ，采用??ｑＲＴ－ＰＣＲ的方法检测细胞内ＭＸＡ基因的表达水平，用以确定干扰素的处理效??果，结果如图４。如图４Ａ所示，将Ｈｕｈ７细胞用ＩＦＮ－ａ２ｂ处理８小时和２４小时??时，细胞内ＭｘＡ基因的转录水平均明显上升，并且处理８小时的细胞中，ＭｘＡ??转录水平高于处理２４小时的细胞样本；如图４Ｂ、４Ｃ所示，ＩＦＮ－ｙ或ＩＦＮ４１处??理Ｈｕｈ７细胞后，ＭＸＡ的转录水平随着处理时间的延长，表达水平也逐渐升高，??并且干扰素处理８小时，对ＭＸＡ的诱导水平已经有２００倍以上。综上可知，??在Ｈｕｈ７细胞中，三种不同类型的干扰素处理细胞８小时均能显著诱导ＭＸＡ基??因转录水平升高，因此最终选择以即ＩＦＮ－ａ２ｂ?（ｌｎｇ／ｍｌ），ＩＦＮ－ｙ?（１５ｎｇ／ｍｌ）和??ＩＦＮ－Ｘ１?（２５ｎｇ／ｍｌ）的处理浓度，处理Ｈｕｈ７细胞８小时，收集的细胞样本，利??用基因芯片的方法对ｍＲＮＡ和ＩｎｃＲＮＡ表达谱进行分析。??Ａ?３００－
【参考文献】：
期刊论文
[1]Emerging complexity and new roles for the RIG-I-like receptors in innate antiviral immunity[J]. John S.Errett,Michael Gale Jr.. Virologica Sinica. 2015(03)
本文编号：3366792
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教材专著
