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小鼠精原细胞分化的蛋白质组学研究

发布时间:2021-10-25 18:01
  对小鼠睾丸中未分化(Undifferentiated)和分化中(Differentiating)的两类精原细胞进行定量蛋白质组研究,探讨两类精原细胞蛋白质组的表达差异,探索与精原细胞分化相关的蛋白质。利用Thy1和c-Kit两个特异抗体结合的磁珠分选技术,分别将生后7 d雄性小鼠睾丸中的Thy1+细胞和c-Kit+细胞分别作为未分化和分化中的精原细胞分选出来,其中Thy1阳性细胞3组,c-Kit阳性细胞4组,分别代表了未分化精原细胞和分化中的精原细胞。采用高效液相色谱串联质谱方法(LC-MS/MS)分析两类细胞蛋白表达差异。并且对两类细胞的差异蛋白进行基因本体(Gene ontology,GO)功能注释、KEGG代谢通路和聚类分析。质谱分析共鉴定了3 228种蛋白,其中有256种蛋白在两类细胞中表达差异。其中,差异蛋白的富集分析发现,在生物过程方面,注释结果显示差异蛋白主要在代谢过程(Primary metabolic process),细胞代谢过程(Cellular metabolic process),分子代谢过程(Macromolecule metabolic process)和... 

【文章来源】:生物技术通报. 2020,36(03)北大核心CSCD

【文章页数】:9 页

【文章目录】:
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 精原细胞的分离、纯化
            1.2.1.1 消化分离小鼠睾丸细胞
            1.2.1.2 磁珠分选纯化精原细胞
        1.2.2 蛋白质谱分析
            1.2.2.1 蛋白质谱分析
            1.2.2.2 蛋白定量比较及生物信息学分析
        1.2.3 细胞标志基因及筛选出通路中重要基因的表达分析
        1.2.4 统计学处理
2 结果
    2.1 两类精原细胞的纯度
    2.2 两类精原细胞蛋白质鉴定基本结果
    2.3 两类精原细胞差异表达蛋白质功能聚类
    2.4 两类精原细胞差异表达蛋白质KEGG注释
    2.5 差异蛋白质层次聚类分析
    2.6 细胞标志基因及筛选出通路中相关基因的表达分析
3 讨论
4 结论


【参考文献】:
期刊论文
[1]Regulation of blood-testis barrier dynamics by the mTORC1/rpS6 signaling complex:an in vitro study[J]. Lin-Xi Li,Si-Wen Wu,Ming Yan,Qing-Quan Lian,Ren-Shan Ge,C Yan Cheng.  Asian Journal of Andrology. 2019(04)
[2]哺乳动物睾丸蛋白质组学研究进展[J]. 孙武,罗静,王丽,李发弟,李万宏,罗莉宁,乐祥鹏.  农业生物技术学报. 2018(10)
[3]生物信息学数据库在医学研究中的应用[J]. 刘银凤,张雷.  中国病原生物学杂志. 2014(10)
[4]iTRAQ技术鉴定小鼠睾丸发育差异表达蛋白的研究[J]. 王黎熔,王静,王富强,王晖.  临床检验杂志. 2010(06)
[5]从基因组学到功能蛋白质组学的研究[J]. 朱沙,张春辉,李鲜菊.  生物学杂志. 2007(01)



本文编号:3457913

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