人DDB2基因及蛋白质的生物信息学分析

发布时间：2021-11-14 05:07

　　分析DNA损伤特异结合蛋白2（DDB2）基因的启动子、CpG岛、转录因子结合位点、基因表达情况;分析DDB2蛋白的理化性质、同源性、亚细胞定位、信号肽和跨膜区域、蛋白质结构及相互作用网络。DDB2基因至少含有2个启动子。启动子区存在2个CpG岛,长度分别109 bp和267 bp,而且至少包含NF-1和Sp1两个转录因子结合位点。DDB2基因在人体正常组织中均有表达,在白血病早幼粒细胞HL-60、721B淋巴母细胞中表达最高。DDB2蛋白是由427个氨基酸组成的无信号肽、无跨膜区域的亲水蛋白。主要定位于细胞核,二级结构以随机卷曲为主。还发现蛋白DDB1、CUL4A、CUL4B、XPA、COPS2、COPS4、COPS8、COPS5、COPS7B、TP53可能与DDB2存在相互作用。生物信息学对于基因及蛋白质研究具有重要作用。本文通过生物信息学的方法对DDB2基因及蛋白质进行分析,为DDB2的实验研究提供理论基础和新的线索。 

【文章来源】：楚雄师范学院学报. 2020,35(03)

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

DDB2基因在人体各种组织的表达

EMBOSS CPGplot预测DDB2基因启动子区的CpG岛（A、B区域为预测的CpG岛位置）

MethPrime预测DDB2基因启动子区的CpG岛（A、B区域为预测的CpG岛位置）

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]探讨DDB2基因对痤疮增生性瘢痕形成及TGF-β/Smads信号通路的影响[D]. 熊梦媛.西南医科大学 2019



本文编号：3494019