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白纹伊蚊微卫星标记的筛选及种群遗传研究

发布时间:2021-12-21 21:59
  目的筛选出有效的白纹伊蚊微卫星标记(SSR),并利用这些SSR分析六个不同地区白纹伊蚊种群遗传特征。方法通过文献查找已公布于数据库的白纹伊蚊SSR位点,利用聚合酶链式反应(PCR)和生物信息学的方法选定白纹伊蚊SSR,ABI3730测序白纹伊蚊基因组中的这些SSR位点,通过STRUCTURE聚类分析和系统进化树分析六个不同地区种群遗传结构。结果查阅文献共找到49个已公布于数据库的白纹伊蚊SSR位点,选取最近发表的29个SSR做PCR鉴定,选取了其中16个多态性高且均匀分布在染色体上的SSR位点,利用这16个SSR位点对6个不同白纹伊蚊种群进行种群遗传分析。分析结果显示地理距离相近的种群遗传距离较近,并确定了最优类群数为2,可将这6个种群分为两个类群,南北方的白纹伊蚊种群分别聚为一个类群。结论通过PCR和生物信息学的方法筛选出的白纹伊蚊SSR位点,能够应用于白纹伊蚊种群遗传研究,并将本研究的6个不同白纹伊蚊种群成功地划分为南北两个类群。

【文章来源】: 现代预防医学. 2020,47(07)北大核心

【文章页数】:5 页

【文章目录】:
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 蚊虫来源
        1.1.2 主要试剂
    1.2 方法
        1.2.1 微卫星位点的检索和生物信息学分析
        1.2.2 微卫星位点的PCR扩增
        1.2.3 数据分析
2 结果
    2.1 微卫星PCR反应和生物信息学分析
    2.2 白纹伊蚊种群遗传多样性
    2.3 白纹伊蚊种群遗传结构
3 讨 论


【参考文献】:
期刊论文
[1]白纹伊蚊微卫星标记的研究进展 [J]. 魏勇,宋璋瑶,郑学礼.  中国病原生物学杂志. 2018(11)



本文编号:3545250

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