两株粘质沙雷菌噬菌体生物学特性和基因组分析
发布时间:2022-07-29 12:13
粘质沙雷菌(Serratia marcescens)是一种杆状的革兰氏阴性细菌,是条件致病菌的一种,主要引起医源性感染。当机体免疫功能下降时,能引起多种感染性疾病,如肺炎、脑膜炎和败血症等。近年来,由于抗生素的大量使用,耐药性粘质沙雷菌的分离率越来越高,耐药菌株引起的爆发流行的案例报道也越来越多,导致了临床治疗粘质沙雷菌感染的难度越来越大。因此,许多学者开始寻找能够替代抗生素的杀菌物质。噬菌体作为专门裂解细菌的病毒,具有严格的宿主特异性,在杀死宿主菌的同时,不会杀死其它正常菌群,是良好的抗生素替代品之一。本研究以多重耐药的粘质沙雷菌为宿主菌,从废水样品中分离出了两株烈性噬菌体,分别命名为vBSmaA2050H1和vBSmaM2050HW,分析和研究了它们的形态学、生物学、分子遗传学和基因组学特征,为多重耐药粘质沙雷菌的防治提供了新的思路。通过双层平板的噬菌斑显示,噬菌体vBSmaA2050H1的噬菌斑小而透明,直径为1.23±0.29 mm;噬菌体vB
【文章页数】:93 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
前言
1 粘质沙雷菌概述
2 噬菌体概述
3 粘质沙雷菌噬菌体的研究现状和进展
4 本研究的内容和意义
第一章 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体的分离
1.1 实验材料
1.1.1 菌种及样品
1.1.2 主要试剂与溶液配制
1.1.3 主要仪器
1.2 实验方法
1.2.1 临床粘质沙雷菌的分离和耐药性分析
1.2.2 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体的分离
1.2.3 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体原种的制备
1.2.4 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体的效价测定
1.3 实验结果
1.3.1 粘质沙雷菌噬菌体宿主的确定
1.3.2 粘质沙雷菌噬菌体的分离
1.3.3 粘质沙雷菌噬菌体原种的制备
1.3.4 粘质沙雷菌噬菌体的噬菌斑特性和效价测定
1.4 讨论与分析
第二章 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体的生物学特性
2.1 实验材料与仪器
2.1.1 菌种与噬菌体
2.1.2 主要试剂
2.1.3 主要仪器
2.2 实验方法
2.2.1 噬菌体颗粒的提取和纯化
2.2.2 透射电镜下观察两株噬菌体的形态
2.2.3 噬菌体一步生长曲线的测量和爆发量的估算
2.2.4 粘质沙雷菌噬菌体宿主谱的研究
2.3 实验结果
2.3.1 粘质沙雷菌噬菌体的显微形态特征
2.3.2 粘质沙雷菌噬菌体的一步生长曲线
2.3.3 粘质沙雷菌噬菌体宿主谱测定结果
2.4 讨论与分析
第三章 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体受体的探究
3.1 实验材料
3.1.1 试验材料
3.1.2 主要仪器
3.2 实验方法
3.2.1 细菌膜蛋白受体验证实验
3.2.2 细菌胞外多糖受体验证实验
3.2.3 热酚水法提取粘质沙雷菌wk2050 的细菌胞外多糖
3.2.4 细菌胞外多糖在体外抑制噬菌体吸附实验
3.3 实验结果
3.3.1 细菌膜蛋白受体验证实验结果
3.3.2 胞外多糖受体验证实验结果
3.3.3 胞外多糖在体外抑制噬菌体吸附的量化实验结果
3.4 讨论与分析
第四章 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体基因组分析
4.1 实验材料
4.1.1 主要试剂
4.1.2 主要仪器
4.2 实验方法
4.2.1 苯酚-氯仿法提取和纯化噬菌体全基因组
4.2.2 噬菌体全基因组测序
4.2.3 噬菌体基因组预测编码ORFs的功能注释
4.2.4 比较基因组学
4.3 实验结果
4.3.1 噬菌体全基因组的提取和纯化
4.3.2 噬菌体全基因组测序
4.3.3 噬菌体基因组预测编码ORFs的功能注释和分析
4.3.4 比较基因组学
4.4 讨论与分析
第五章 结论和展望
5.1 结论
5.1.1 噬菌体的分离
5.1.2 噬菌体生物学性状
5.1.3 噬菌体受体初步探究
5.1.4 噬菌体全基因组分析
5.2 展望
参考文献
附录A 附表
作者在学期间取得的学术成果
附件
主要简历
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]噬菌体治疗泛耐药鲍氏不动杆菌重症感染小鼠的研究[J]. 闫李侠,黄至澄,任应鹏,李恪梅,陈保文,王国治. 中国人兽共患病学报. 2017(10)
[2]沙雷菌裂解性噬菌体PS2生物学特性及其全基因组测序[J]. 张改,李振江,靳静,王书伟,陈松建,李亚辉,黄德海,王小亭,王山梅,王中全. 中国人兽共患病学报. 2017(09)
[3]食源性金黄色葡萄球菌粘附素基因的检测及蛋白酶K和DNase Ⅰ对菌株被膜形成的影响[J]. 马伊萨兰,余博旸,陈娟,刘骥,唐俊妮. 食品工业科技. 2016(17)
[4]铜绿假单胞菌噬菌体D204的生物学特性和基因组学研究[J]. 徐彬,高晶,郭晓奎,秦金红. 上海交通大学学报(医学版). 2016(01)
[5]粪肠球菌裂解性噬菌体φEn-ZZ8生物学特性的初步分析[J]. 张哲,李菁华,逯茵茵,韩放,李诗恒,孙延波. 微生物与感染. 2015(04)
[6]粘质沙雷菌毒性噬菌体PS4的生物学特性及其在小鼠血清中的杀菌作用研究[J]. 靳静,张改,李振江,王书伟,陈松建,黄德海,李亚辉,王小亭,王中全. 中国病原生物学杂志. 2015(02)
[7]一起导管相关黏质沙雷菌血流感染暴发[J]. 潘军,许青霞,肖伟强,常彦敏,赵霞. 中国感染控制杂志. 2014(10)
[8]2010—2012年粘质沙雷菌耐药性变迁[J]. 虞军雷,应华永,徐瑞龙. 现代实用医学. 2014(06)
[9]粘质沙雷菌裂解性噬菌体ФSM9-3Y的分离和鉴定[J]. 徐花,余静丹,王丹,温剑平,孙延波. 微生物学免疫学进展. 2013(02)
[10]噬菌体RAP44感染鸭疫里默氏菌的电镜观察[J]. 程龙飞,陈红梅,施少华,傅光华,陈文列,林如辉,万春和,黄瑜. 中国预防兽医学报. 2013(02)
硕士论文
[1]禽源大肠杆菌烈性噬菌体的分离鉴定及功能基因组学分析[D]. 李彦哲.南京农业大学 2013
[2]蝙蝠蛾拟青霉多糖的结构及活性研究[D]. 曾世明.东北师范大学 2011
[3]大肠杆菌K88噬菌体的分离、分类初步鉴定和生物学特性的测定[D]. 代保英.扬州大学 2009
本文编号:3666446
【文章页数】:93 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
前言
1 粘质沙雷菌概述
2 噬菌体概述
3 粘质沙雷菌噬菌体的研究现状和进展
4 本研究的内容和意义
第一章 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体的分离
1.1 实验材料
1.1.1 菌种及样品
1.1.2 主要试剂与溶液配制
1.1.3 主要仪器
1.2 实验方法
1.2.1 临床粘质沙雷菌的分离和耐药性分析
1.2.2 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体的分离
1.2.3 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体原种的制备
1.2.4 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体的效价测定
1.3 实验结果
1.3.1 粘质沙雷菌噬菌体宿主的确定
1.3.2 粘质沙雷菌噬菌体的分离
1.3.3 粘质沙雷菌噬菌体原种的制备
1.3.4 粘质沙雷菌噬菌体的噬菌斑特性和效价测定
1.4 讨论与分析
第二章 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体的生物学特性
2.1 实验材料与仪器
2.1.1 菌种与噬菌体
2.1.2 主要试剂
2.1.3 主要仪器
2.2 实验方法
2.2.1 噬菌体颗粒的提取和纯化
2.2.2 透射电镜下观察两株噬菌体的形态
2.2.3 噬菌体一步生长曲线的测量和爆发量的估算
2.2.4 粘质沙雷菌噬菌体宿主谱的研究
2.3 实验结果
2.3.1 粘质沙雷菌噬菌体的显微形态特征
2.3.2 粘质沙雷菌噬菌体的一步生长曲线
2.3.3 粘质沙雷菌噬菌体宿主谱测定结果
2.4 讨论与分析
第三章 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体受体的探究
3.1 实验材料
3.1.1 试验材料
3.1.2 主要仪器
3.2 实验方法
3.2.1 细菌膜蛋白受体验证实验
3.2.2 细菌胞外多糖受体验证实验
3.2.3 热酚水法提取粘质沙雷菌wk2050 的细菌胞外多糖
3.2.4 细菌胞外多糖在体外抑制噬菌体吸附实验
3.3 实验结果
3.3.1 细菌膜蛋白受体验证实验结果
3.3.2 胞外多糖受体验证实验结果
3.3.3 胞外多糖在体外抑制噬菌体吸附的量化实验结果
3.4 讨论与分析
第四章 多重耐药粘质沙雷菌噬菌体基因组分析
4.1 实验材料
4.1.1 主要试剂
4.1.2 主要仪器
4.2 实验方法
4.2.1 苯酚-氯仿法提取和纯化噬菌体全基因组
4.2.2 噬菌体全基因组测序
4.2.3 噬菌体基因组预测编码ORFs的功能注释
4.2.4 比较基因组学
4.3 实验结果
4.3.1 噬菌体全基因组的提取和纯化
4.3.2 噬菌体全基因组测序
4.3.3 噬菌体基因组预测编码ORFs的功能注释和分析
4.3.4 比较基因组学
4.4 讨论与分析
第五章 结论和展望
5.1 结论
5.1.1 噬菌体的分离
5.1.2 噬菌体生物学性状
5.1.3 噬菌体受体初步探究
5.1.4 噬菌体全基因组分析
5.2 展望
参考文献
附录A 附表
作者在学期间取得的学术成果
附件
主要简历
致谢
【参考文献】:
期刊论文
[1]噬菌体治疗泛耐药鲍氏不动杆菌重症感染小鼠的研究[J]. 闫李侠,黄至澄,任应鹏,李恪梅,陈保文,王国治. 中国人兽共患病学报. 2017(10)
[2]沙雷菌裂解性噬菌体PS2生物学特性及其全基因组测序[J]. 张改,李振江,靳静,王书伟,陈松建,李亚辉,黄德海,王小亭,王山梅,王中全. 中国人兽共患病学报. 2017(09)
[3]食源性金黄色葡萄球菌粘附素基因的检测及蛋白酶K和DNase Ⅰ对菌株被膜形成的影响[J]. 马伊萨兰,余博旸,陈娟,刘骥,唐俊妮. 食品工业科技. 2016(17)
[4]铜绿假单胞菌噬菌体D204的生物学特性和基因组学研究[J]. 徐彬,高晶,郭晓奎,秦金红. 上海交通大学学报(医学版). 2016(01)
[5]粪肠球菌裂解性噬菌体φEn-ZZ8生物学特性的初步分析[J]. 张哲,李菁华,逯茵茵,韩放,李诗恒,孙延波. 微生物与感染. 2015(04)
[6]粘质沙雷菌毒性噬菌体PS4的生物学特性及其在小鼠血清中的杀菌作用研究[J]. 靳静,张改,李振江,王书伟,陈松建,黄德海,李亚辉,王小亭,王中全. 中国病原生物学杂志. 2015(02)
[7]一起导管相关黏质沙雷菌血流感染暴发[J]. 潘军,许青霞,肖伟强,常彦敏,赵霞. 中国感染控制杂志. 2014(10)
[8]2010—2012年粘质沙雷菌耐药性变迁[J]. 虞军雷,应华永,徐瑞龙. 现代实用医学. 2014(06)
[9]粘质沙雷菌裂解性噬菌体ФSM9-3Y的分离和鉴定[J]. 徐花,余静丹,王丹,温剑平,孙延波. 微生物学免疫学进展. 2013(02)
[10]噬菌体RAP44感染鸭疫里默氏菌的电镜观察[J]. 程龙飞,陈红梅,施少华,傅光华,陈文列,林如辉,万春和,黄瑜. 中国预防兽医学报. 2013(02)
硕士论文
[1]禽源大肠杆菌烈性噬菌体的分离鉴定及功能基因组学分析[D]. 李彦哲.南京农业大学 2013
[2]蝙蝠蛾拟青霉多糖的结构及活性研究[D]. 曾世明.东北师范大学 2011
[3]大肠杆菌K88噬菌体的分离、分类初步鉴定和生物学特性的测定[D]. 代保英.扬州大学 2009
本文编号:3666446
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/jichuyixue/3666446.html
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