一株新型裂解K63荚膜型肺炎克雷伯菌的噬菌体分离鉴定和生物学特性研究及全基因组分析

发布时间：2023-10-01 22:51

　　[背景]噬菌体具有特定的杀菌能力,对生态和细菌的进化具有重要影响。近年来由于多重耐药细菌的全球出现,噬菌体疗法逐渐引起了人们的关注。[目的]对一株新型裂解K63荚膜型肺炎克雷伯菌的噬菌体vB_KpnP_IME308进行生物学特性研究、测序和比较基因组学的分析。[方法]以一株从临床分离到的肺炎克雷伯菌为宿主菌分离噬菌体,应用双层平板法进行噬菌体最佳感染复数(optimal multiplicity of infection)、一步生长曲线(one-step growth curve)、温度以及pH敏感性实验测定,纯化噬菌体并通过透射电镜观察噬菌体形态;应用标准的苯酚-氯仿提取方案提取噬菌体全基因组,使用Illumina MiSeq测序平台进行噬菌体全基因组测序,测序后对噬菌体全基因组序列进行组装、注释、进化和比较基因组学分析。[结果]分离到一株新型的肺炎克雷伯菌噬菌体,命名为vB_KpnP_IME308;其最佳感染复数为0.001,一步生长曲线结果显示,其感染宿主菌的潜伏期约为20 min,裂解期约为80 m...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 菌株来源与培养条件
        1.1.2 培养基及主要试剂和仪器
    1.2 噬菌体的分离鉴定
    1.3 噬菌体最佳感染复数(multiplicity of infection,MOI)测定
    1.4 噬菌体一步生长曲线(one-step growth)的测定
    1.5 噬菌体温度和p H敏感性的测定
    1.6 噬菌体电镜
    1.7 噬菌体基因组提取
    1.8 噬菌体的全基因组测序及生物信息学分析
2 结果与分析
    2.1 噬菌体的分离与鉴定
    2.2 噬菌体的形态学特征
    2.3 噬菌体最佳感染复数
    2.4 噬菌体的一步生长曲线
    2.5 噬菌体温度和p H的敏感性
    2.6 噬菌体的全基因组分析
    2.7 噬菌体v B＿KpnP＿IME308比较基因组学分析及系统进化树的构建
3 讨论与结论



本文编号：3849594