云南省不同感染来源间日疟原虫环子孢子蛋白基因多态和种群结构分析

发布时间：2023-10-29 19:58

　　目的分析云南省不同感染来源间日疟原虫环子孢子蛋白(Pvcsp)基因序列,揭示当地Pvcsp基因的种群结构和遗传多样性。方法收集中国疾病预防控制中心传染病网络直报系统中2014-2017年报告的云南省本地和输入性间日疟病例流行病学资料及血样。提取血样中疟原虫基因组DNA,巢式PCR扩增并测序。采用MEGA 5.04、Arlequin 3.5.2.2软件进行单倍型、期望杂合度(He)分析,DnaSP 5.10计算核苷酸多样性(TT)、同义置换率(Ks)、错义置换率(Ka)及群体间遗传分化指数(Fst)。结果共检测间日疟病例血样969份,扩增获得650～750 bp大小的目的条带759份,包括云南本地感染者血样39份、非洲16份、缅甸688份、老挝13份、柬埔寨2份、巴基斯坦1份。单倍型分析结果显示,759条Pvcsp基因序列存在90个单倍型,其中29个为PV-I型温带族(类似VK210型),50个为PV-Ⅰ型热带族(类似VK210型),11个为PV-Ⅱ型(类似VK247型);3种基因型所占比例分别为51.4%(390/759)、41.1%(312/759)、7.5%(57/759),分布于...

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样本来源
    1.2 主要试剂
    1.3 Pvcsp基因扩增及测序
    1.4 Pvcsp基因型和多态性分析
2 结果
    2.1 Pvcsp基因的PCR扩增结果
    2.2 Pvcsp基因型和氨基酸序列分析
    2.4 Pvcsp基因遗传分化的群体差异
3 讨论



本文编号：3858767