广州市两株人感染H5N6禽流感病毒全基因组序列特征分析

发布时间：2024-05-21 02:59

　　H5N6禽流感是重要的人兽共患病,给公共卫生带来严重威胁。为研究人感染H5N6禽流感病毒的基因特征,本文对广州市两株人感染H5N6禽流感病毒进行全基因组序列扩增,应用生物信息学软件分析分子变异和遗传进化特征。结果显示:两毒株各基因片段同源性存在差异,血凝素(Hemagglutinin,HA)基因同源性最高为98.3%,PB2基因同源性最低为85.2%。A/Guangzhou/41641/2014(H5N6)病毒的HA、神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)、聚合酶碱性蛋白2(Polymerase basic protein 2,PB2)基因与猫源毒株A/feline/Guangdong/1/2015(H5N6)亲缘关系较近,推测可能起源于共同祖先。两株病毒均为禽源高致病性病毒,HA和NA表面蛋白受体结合位点、裂解位点和耐药位点未发生变异。内部基因重要位点均有不同程度的变异,其中以41641病毒变异较大,并发生PB2蛋白E627K突变。两株病毒均发生与不同亚型病毒之间的重组现象,41641病毒的内部基因分别与H5和H9N2/H7N9发生重组,其中PB2和PB1基因分别与2013年...

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图8NS1基因遗传进化树

图7M1基因遗传进化树

图5PA基因遗传进化树

图6NP基因遗传进化树图7M1基因遗传进化树

图7M1基因遗传进化树

图5PA基因遗传进化树图8NS1基因遗传进化树

图1HA基因遗传进化树

进化分析结果显示，两株病毒HA基因分别与A/feline/Guangdong/1/2015(H5N6）和A/chicken/Zhejiang/217/2016(H5N2）等广东分离株亲缘关系较近，位于Clade2.3.4.4.C分支；两株病毒NA基因归属于H5N6进化分支，位于....

本文编号：3979509