CODEHOP RT-PCR方法在汉坦病毒基因型别鉴定和分子溯源中的应用

发布时间：2017-06-26 03:20

  本文关键词：CODEHOP RT-PCR方法在汉坦病毒基因型别鉴定和分子溯源中的应用，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的分析CODEHOP RT-PCR方法对于汉坦病毒(HV)基因型别鉴定和分子溯源中的应用效果。方法选取实验室保存的汉滩型病毒阳性鼠肺样品DX0901和汉城型病毒阳性鼠肺样品DX1101,用CODEHOP RT-PCR扩增HV病毒L基因片段并测序,进行Blast同源性比对和系统发生分析。结果两份样品均获得478bp大小的RT-PCR扩增产物,汉滩病毒DX0901与汉滩病毒株Nc167同源性最为接近,遗传距离为0.142。汉城病毒DX1101与汉城病毒株ZT10,ZT71,Z37同源性最为接近,遗传距离为0.049。结论 CODEHOP RT-PCR方法可以有效的用于对汉坦病毒进行基因型别鉴定和分子溯源。
【作者单位】： 大榭出入境检验检疫局;
【关键词】： 汉坦病毒 CODEHOP RT-PCR 基因型别 分子溯源
【基金】：国家质检总局科技支撑项目(No.2012IK233)~~
【分类号】：R373
【正文快照】： 汉坦病毒(Hantavirus,HV)属于布尼亚病毒科(Bunyaviridae)汉坦病毒属(geneus hantavirus)[1]。根据汉坦病毒基因分子结构和抗原性的不同,将汉坦病毒至少分为34个血清型/基因型[2-3],包括汉滩型病毒(Hantaan Virus,HTNV),汉城型病毒(Se-oul Virus,SEOV),普马拉型病毒(Puumala V

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 吴守丽,严延生,何似,李世清;汉坦病毒基因分型方法的建立及其核苷酸序列特征分析[J];中国人兽共患病杂志;2005年09期

2 胡群;马思杰;王静;倪红霞;;汉坦病毒群CODEHOP RT-PCR检测方法的建立[J];中国病原生物学杂志;2012年06期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前5条

1 胡群;郑剑宁;马思杰;韩辉;孙肖红;;CODEHOP RT-PCR技术在黄病毒属病毒筛查中应用[J];病毒学报;2014年02期

2 余向华;曾士典;张孝和;倪庆翔;魏晶娇;倪朝荣;李毅;;浙江南部沿海地区鼠传疾病流行趋势分析[J];疾病监测;2014年05期

3 胡群;马思杰;王静;倪红霞;;汉坦病毒群CODEHOP RT-PCR检测方法的建立[J];中国病原生物学杂志;2012年06期

4 胡群;马思杰;孙肖红;李永东;;黄病毒属病毒CODEHOP RT-PCR检测方法的建立[J];中国病原生物学杂志;2013年10期

5 胡群;马思杰;裘炯良;邹春颖;童淑梅;;鼠类感染沙粒病毒CODEHOP RT-PCR检测方法的建立[J];中国病原生物学杂志;2013年12期

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前7条

1 白雪帆，黄长形，孙永涛，，杨为松，尚高峰，周永兴，李光玉;聚合酶链反应技术用于汉坦病毒的基因分型[J];第四军医大学学报;1996年02期

2 金光香,王世文;汉坦病毒基因分型研究进展[J];中国地方病防治杂志;2003年03期

3 夏瑞;陆旺金;李建国;杜娟;;简并引物的程序化设计与荔枝HMGR基因片段的克隆[J];果树学报;2006年06期

4 黄菁,王少丽,乔传令;程序化设计简并引物与克隆小菜蛾酯酶基因[J];昆虫知识;2002年06期

5 刘雅婷;张文超;李正跃;李成云;朱有勇;李永忠;;布尼亚病毒科全基因组序列比对分析[J];云南农业大学学报;2008年03期

6 张斌,白雪帆,刘安,杨为松;应用煮沸法-半套式-聚合酶链反应快速检测汉坦病毒感染[J];中华传染病杂志;1998年02期

7 李家亮,李德新;汉坦病毒病原学研究进展[J];中华实验和临床病毒学杂志;2005年02期

【相似文献】

中国期刊全文数据库 前10条

1 郭瑜;刘晓燕;胡惠梅;陈斯勇;伊瑶;陈向伟;毕胜利;;山西省乙型肝炎病毒基因型别的初步研究[J];中华实验和临床病毒学杂志;2006年04期

2 朱贞;许文波;;风疹病毒的分子流行病学[J];中国计划免疫;2007年04期

3 俞莲花;潘春琴;胡大康;刘池波;张瑾;;大肠埃希菌新的氨基糖苷类修饰酶基因型别研究[J];中华医院感染学杂志;2008年06期

4 董菁,任建林,卢雅丕;乙型肝炎病毒蛋白表型定义初探[J];世界华人消化杂志;2004年09期

5 胡钰;李凡;;2006年吉林省野生型麻疹病毒分离鉴定及核蛋白基因序列分析[J];中国卫生检验杂志;2007年08期

6 丁晓艳;陆培善;还锡平;陶红;马福宝;汪华;许松涛;许文波;;江苏省2007年麻疹野毒株基因特征分析[J];中国疫苗和免疫;2008年06期

7 刘红;蒋晓飞;阮斐怡;李敏;艾芙琪;马逸珉;洪秀华;吕元;;多重耐药阴沟肠杆菌临床分离株ESBLs基因型别和分子流行病学分析[J];中华医院感染学杂志;2006年05期

8 詹惠春;聂军;唐亚丽;李建栋;戴迎春;陈清;俞守义;;广州成人散发急性腹泻中诺瓦克样病毒感染及毒株型别初步研究[J];热带医学杂志;2007年01期

9 杨秀惠;何爱华;许江阳;陈雅红;张宏;陈前进;陈昌福;张红榕;周勇;;2002-2007年福建省麻疹野病毒的分离与基因特性分析[J];海峡预防医学杂志;2010年01期

10 周德久，曹逸云，黄小琴，董德祥;H_2株甲肝减毒活疫苗K_7的核苷酸全序列分析[J];云南大学学报(自然科学版);1999年03期

中国重要会议论文全文数据库 前10条

1 胡龙华;余方友;熊建球;胡晓彦;贾坤如;况九龙;桂炳东;;肺炎克雷伯菌临床分离株产超广谱β-内酰胺酶的基因型研究[A];中华医学会第七次全国检验医学学术会议资料汇编[C];2008年

2 彭劲松;;武汉市吸毒人群HCV感染状况的研究[A];中国免疫学会第五届全国代表大会暨学术会议论文摘要[C];2006年

3 袁达康;;东莞市2008年麻疹野病毒基因型分析[A];新发和再发传染病防治热点研讨会论文集[C];2009年

4 董红军;宋启发;林晖;金春光;许国章;徐景野;;腥红热爆发病例中A群链球菌基因型别和毒力基因研究[A];2007年浙江省医学病毒学、医学微生物与免疫学学术年会论文汇编[C];2007年

5 陈贤君;李克诚;韩立中;陈慧红;倪语星;;产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌科细菌的基因型研究[A];2006年浙江省检验医学学术年会论文汇编[C];2006年

6 涂亚庭;陈宏翔;吴志洪;陈嵘垎;帅俊;严小枫;刘厚君;林能兴;黄长征;;淋球菌毒力岛分类及sac-4基因对淋球菌血清抗性作用的研究[A];2009全国中西医结合皮肤性病学术会议论文汇编[C];2009年

7 李庆云;万欢英;李敏;王晓斐;黄绍光;;中国南方汉族人触珠蛋白遗传多态性与阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征合并心血管损害的关系[A];中华医学会第七次全国呼吸病学术会议暨学习班论文汇编[C];2006年

8 吕晓萍;李体远;戴勇;童秋生;熊峰;李放娟;李晓梅;李芳芳;;尖锐湿疣患者感染HPV基因型的分布及其临床意义[A];中华医学会第十二次全国皮肤性病学术会议论文集[C];2006年

9 黄振武;龚洁;李芳;;基因多态对妇女产后骨密度自我恢复以及补钙效果的影响[A];中国营养学会第十届微量元素营养学术会议论文摘要汇编[C];2009年

10 杨丽琛;朴建华;董杰;黄振武;张倩;马冠生;;ER-α基因多态性与中国青春期少女骨骼发育状况相关性研究[A];中国营养学会论文汇编之二[C];2007年

中国博士学位论文全文数据库 前10条

1 杨丽萍;山东地区秋冬型恙虫病流行病学研究[D];山东大学;2008年

2 俞雪莲;上海部分地区成人感染麻疹病毒的分子流行病学及致病机制研究[D];复旦大学;2008年

3 孙彩虹;特殊皮肤疣中人乳头瘤病毒感染状况的临床特征和基因分型研究[D];中国协和医科大学;2009年

4 张芳;我国土拉弗氏菌分子流行病学调查研究[D];中国人民解放军军事医学科学院;2008年

5 李红敏;广西女性性工作者人乳头状瘤病毒流行概况及基因型别分布的研究[D];北京协和医学院;2012年

6 李淑华;计划免疫后麻疹流行特征与预防策略研究[D];复旦大学;2007年

7 边涛;我国乙型肝炎病毒基因型别地区分布和变异研究[D];中国疾病预防控制中心;2008年

8 袁媛;两种单基因遗传病的致病基因定位及产前诊断[D];武汉大学;2010年

9 宋学勤;首发精神分裂症IL-1β、TNF-α、IL-6的水平、基因多态性及NF-κB调控作用的研究[D];中南大学;2006年

10 李淼;FAS凋亡通路基因单核苷酸多态性与中国汉族人群白癜风相关性的研究[D];第四军医大学;2008年

中国硕士学位论文全文数据库 前10条

1 李志宾;乌鲁木齐地区78例HCV感染者基因型及亚型的临床研究[D];新疆医科大学;2010年

2 黄辉红;HCV基因型和亚型：分型技术、临床意义及其流行病学研究[D];南方医科大学;2010年

3 李宁;外周血清中丙型肝炎病毒RNA的检测并应用基因芯片法对其基因分型的研究[D];辽宁中医学院;2005年

4 贺晨;长春龙嘉国际机场口岸鼠间肾综合征出血热监测[D];吉林大学;2007年

5 曹鸿霞;安徽省部分医院金黄色葡萄球菌的耐药性检测及耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的检测和基因分型[D];安徽医科大学;2007年

6 纪冰;金黄色葡萄球菌耐药表型特征及耐药机制研究[D];安徽医科大学;2007年

7 李韵松;腹腔、胆道感染常见致病菌大肠埃希菌中超广谱β-内酰胺酶的研究[D];昆明医学院;2009年

8 孙光明;耐甲氧西林金黄色葡萄球菌检测方法及耐药机制的研究[D];安徽医科大学;2006年

9 魏亚梅;河北省人感染汉坦病毒M片段基因特征研究[D];河北医科大学;2007年

10 牛淑芳;人乳头瘤病毒与宫颈病变的相关研究[D];山西医科大学;2007年

  本文关键词：CODEHOP RT-PCR方法在汉坦病毒基因型别鉴定和分子溯源中的应用，由笔耕文化传播整理发布。

本文编号：484637