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公共场所冷却塔水嗜肺军团菌的基因序列分型研究

发布时间:2017-08-09 17:01

  本文关键词:公共场所冷却塔水嗜肺军团菌的基因序列分型研究


  更多相关文章: 嗜肺军团菌 序列分型 聚类分析 管家基因


【摘要】:目的为了解温州市中央空调冷却塔水中嗜肺军团菌(Legionella pneumophila,LP)基因特征,采用序列分型方法(sequenced-based typing,SBT)对公共场所中央空调冷却塔水中的嗜肺军团菌进行分子分型研究。方法选择嗜肺军团菌的7个管家基因flaA、asd、mip、pilE、mompS、proA和neuA作为目的基因,对温州市公共场所中央空调冷却塔水中分离的31株嗜肺军团菌进行PCR扩增并测序。测序结果上传欧盟军团菌感染工作组(EWGLI)数据库进行比对、分型。运用DNAsp 5.0、Bionumerics5.1及SplitsTree等软件对分型结果进行分析。结果 31株嗜肺军团菌中,11株LP1型被分为2种ST型;17株非LP1型被分为8种ST型,其中7种ST型是新发现的序列型,并新发现1个等位基因;另3株非LP1型因缺少neuA基因未被数据库确认。7个管家基因的核苷酸多态性(Pi)范围为0.00995(mip)~0.02311(flaA)。flaA具有最大的核苷酸多态性(0.02311)。经聚类分析得到本地分离的嗜肺军团菌株的遗传进化关系。结论温州市公共场所冷却塔水中的嗜肺军团菌与国内外其他地区报道的嗜肺军团菌具有一定的亲缘关系,同时也具有地区特异性和遗传多样性。
【作者单位】: 温州市疾病预防控制中心;上海市疾病预防控制中心;
【关键词】嗜肺军团菌 序列分型 聚类分析 管家基因
【基金】:温州市2010科技计划项目(No.Y20100022)~~
【分类号】:R378
【正文快照】: 军团菌属(Legionella)普遍存在于天然淡水环境中,是引起军团病的重要病原体。大部分军团菌病由嗜肺军团菌菌种感染引起,其中又以嗜肺军团菌1型为主。在军团菌的检测方法中,血清学分型方法是基本的分型方法,但军团菌血清普遍存在一定的交叉反应,给军团菌的分型带来一定的影响

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前2条

1 张颖;屈平华;张健;陈守义;;广州地区嗜肺军团菌环境分离株的基因序列分型分析[J];微生物学报;2011年03期

2 宣瑞红;胡朝晖;朱庆义;;军团菌测序鉴定与分子分型研究进展[J];中国自然医学杂志;2010年01期

【共引文献】

中国期刊全文数据库 前1条

1 郭玉梅;周吉坤;剧慧栋;秦丽云;王苋;徐保红;吕国平;;石家庄市集中空调冷却塔水中嗜肺军团菌的基因序列分型研究[J];环境与健康杂志;2012年09期

【二级参考文献】

中国期刊全文数据库 前3条

1 路凤;金银龙;程义斌;;军团菌病的流行概况[J];国外医学(卫生学分册);2008年02期

2 陆建红;张e,

本文编号:646323


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