白眉蝮蛇降纤酶的同源模建及B细胞抗原表位预测

发布时间：2017-08-12 19:36

  本文关键词：白眉蝮蛇降纤酶的同源模建及B细胞抗原表位预测

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【摘要】：白眉蝮蛇降纤酶是我国在临床上用来治疗血栓栓塞性疾病的国家基本药物。但该酶来源于蛇毒,是异源蛋白,且是大分子蛋白质,不可避免的存在免疫原性问题。另外该蛋白药物在我国使用规模很大,因此由免疫原性导致的安全性问题不容忽视。首先通过DNAStar软件和ABCpred、BCPREDS等服务器预测得到肽端AA27~35、44~50、66~72、79~98、101~109、117~127、134~142、151~164、179~188、194~206、221~233、247~260区域为白眉蝮蛇降纤酶的B细胞线性表位优势区域。然后以蝮蛇毒蛋白C激活剂蛋白的晶体结构为模板,利用MODELLER 9.10软件中的Pythonwin程序进行白眉蝮蛇降纤酶的同源模建,并利用PROCHECK、ERRAT及PROSA程序进行同源模建的合理化评价。根据白眉蝮蛇降纤酶的模建三维结构并结合DiscoTope和cons PPISP网络数据库预测B细胞构象型抗原表位。得到蛋白的N端45~51、81~90、95~106、134~141、153~159、177~182、225~232、251~257区段为白眉蝮蛇降纤酶的B细胞构象型表位区域。本项目的预期成果将为降纤酶药物的安全化应用提供新思路,为蛋白质药物免疫原性机制研究提供技术基础。
【作者单位】： 大连理工大学生命科学与技术学院;
【关键词】： 降纤酶 免疫原性 线性表位 构象型表位 同源模建 长白山白眉蝮蛇
【基金】：国家自然科学基金项目(81102378) 中央高校基本科研业务费专项资金(DUT11SM02)
【分类号】：R392.1
【正文快照】： 凝血酶(Thrombin-like enzyme,TLE)主要来源于蛇毒,具有裂解纤维蛋白原的活性[1-2]。从长白山白眉蝮蛇(Agkistrodon halys ussuriensis)或尖吻蝮蛇(Agkistrodon acutus)蛇毒中提取的类凝血酶由中国卫生部命名为降纤酶(Defibrase),已应用于临床,是预防和治疗心脑血管闭塞性疾

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前1条

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【共引文献】

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本文编号：663307