泌尿生殖道感染沙眼衣原体PmpF基因多态性及分布特征

发布时间：2018-03-20 08:57

  本文选题：沙眼衣原体　切入点：泌尿生殖道　出处：《第三军医大学学报》2017年07期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：目的探讨泌尿生殖道感染沙眼衣原体PmpF基因的多态性及与临床感染的关系。方法收集2013年1月到2014年12月于解放军252医院就诊患者送检的泌尿生殖道分泌物标本,标本处理后使用沙眼衣原体核酸检测试剂盒筛选阳性标本,然后以巢式PCR扩增PmpF基因,扩增得到的PmpF基因选用4种内切酶进行酶切及RFLP分析并确定其基因型,根据PmpF-RFLP结果,选择代表菌株测定PmpF基因序列进行系统发育分析,进一步验证PmpF-RFLP结果,同时测定代表菌株的Omp1基因序列并与参考菌株进行比较,从而确定代表菌株的血清型。通过χ~2检验探讨沙眼衣原体PmpF基因型与患者性别、年龄的关系以反映其临床分布特征。结果 2年间从妇科、泌尿科和皮肤科3个科室获得阳性标本178份,117份标本扩增得到PmpF基因,PmpF-RFLP将117份标本分为3个Type型,占比分别为2.6%、36.8%、60.7%,挑选26株菌株进行Omp1序列测定,结果显示26株菌株属于D、Da、E、F、G、H、J 7种血清型,统计学分析表明PmpF基因型与患者性别、年龄的Fisher精确检验值分别为0.167、0.008。结论本地区引起泌尿生殖道感染的沙眼衣原体可以根据PmpF基因分成3个基因型,包括D、Da、E、F、G、H、J 7种血清型,血清型与PmpF基因型无对应关系,PmpF基因型与患者年龄有关,与性别无关。
[Abstract]:Objective to investigate the polymorphism of Chlamydia trachomatis PmpF gene in urogenital tract infection and its relationship with clinical infection. The positive samples were screened by chlamydia trachomatis nucleic acid detection kit, and the PmpF gene was amplified by nested PCR. The PmpF gene was digested by four endonuclease and RFLP analysis, and its genotype was determined according to the results of PmpF-RFLP. The PmpF gene sequence of the representative strain was selected for phylogenetic analysis to further verify the results of PmpF-RFLP, and the Omp1 gene sequence of the representative strain was determined and compared with the reference strain. The relationship between PmpF genotype of chlamydia trachomatis and sex and age of patients was studied to reflect the clinical distribution characteristics of chlamydia trachomatis. There were 178 positive specimens obtained from 3 departments of urology and dermatology. PmpF gene PmpF-RFLP was amplified from 117 samples. 117 samples were divided into 3 Type types, accounting for 2.6% and 36.8% respectively. 26 strains were selected for Omp1 sequencing. The results showed that the 26 strains belonged to 7 serotypes of Dendazone, and the statistical analysis showed that the genotype of PmpF was associated with the sex of the patients. The accurate test values of Fisher for age were 0.167 0. 008.Conclusion Chlamydia trachomatis caused by genitourinary tract infection in this area can be divided into three genotypes according to PmpF gene, including 7 serotypes of PmpF. There was no correlation between serotype and PmpF genotype.
【作者单位】： 河北北方学院病原生物学研究所;保定市第一中心医院检验科;解放军252医院检验科;
【基金】：河北北方学院创新人才项目(CXRC1317)~~
【分类号】：R691.3

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本文编号：1638373