DNA损伤修复基因多态性与膀胱癌发生风险的相关性
本文选题：DNA损伤修复基因 + 单核苷酸多态性 ； 参考：《兰州大学》2016年博士论文
【摘要】：目的:DNA损伤和修复之间的平衡在膀胱癌的发展进程中扮演着重要角色。本课题对汉族人群7个DNA损伤修复基因(PARP1,OGG1,APEX1,MUTYH,XRCC1,XRCC2和XRCC3)中19个单核苷酸多态性位点(SNP)与膀胱癌发生风险的相关性进行研究,同时探讨了DNA损伤修复过程中存在的单基因SNPs的协同作用和多基因SNPs的交互作用机制。方法与结果:应用Taq Man Open Array基因芯片技术对中国甘肃地区227名膀胱癌患者和260名正常对照进行了高通量基因分型分析。结果显示:APEX1基因rs3136817位点,MUTYH基因rs3219493位点,XRCC1基因三个位点(rs3213356,rs25487和rs1799782),XRCC3基因三个位点(rs1799794,rs861531和rs861530)与膀胱癌的发生风险有显著相关性。其中APEX1基因TC基因型和C等位基因相比TT基因型和T等位基因发生膀胱癌的风险均会显著降低(P=0.002,adjusted OR=0.48,95%CI:0.30-0.77;P=0.005,adjusted OR=0.56,95%CI:0.38-0.84);MUTYH基因rs3219493位点G等位基因相比C等位基因发生膀胱癌的风险显著升高(P=0.002,adjusted OR=1.80,95%CI:1.24-2.61);XRCC1基因rs3213356位点CT基因型相比TT基因型发生膀胱癌的风险显著降低(P=0.002,adjusted OR=0.43,95%CI:0.25-0.74),而CC基因型相比TT基因型发生膀胱癌的风险显著升高(P=0.005,adjusted OR=5.76,95%CI:1.69-19.67);XRCC1基因rs25487位点CT基因型相比CC基因型发生膀胱癌的风险显著降低(P=0.002,adjusted OR=0.48,95%CI:0.31-0.76);XRCC1基因rs1799782位点AA基因型相比GG基因型发生膀胱癌的风险显著升高(P=0.005,adjusted OR=2.67,95%CI:1.35-5.26);XRCC3基因rs1799794位点TC基因型相比TT基因型发生膀胱癌的风险显著降低(P=0.001,OR=0.33,95%CI:0.20-0.55);XRCC3基因rs861531位点AC基因型相比CC基因型发生膀胱癌的风险显著降低(P=0.008,adjusted OR=0.47,95%CI:0.27-0.82);XRCC3基因rs861530位点CT基因型相比TT基因型发生膀胱癌的风险显著降低(P=0.002,adjusted OR=0.48,95%CI:0.30-0.78)。单体型分析显示,APEX1基因GT单体型(P=0.003,adjusted OR=1.56,95%CI:1.17-2.09)和XRCC1基因GGGTC单体型(P=0.002,adjustedOR=2.05,95%CI:1.30-2.24)的携带者发生膀胱癌的风险显著增高,而MUTYH基因CCC单体型(P=0.004,adjusted OR=0.65,95%CI:0.49-0.87)和XRCC3基因TTTAT单体型(P=0.009,adjusted OR=0.36,95%CI:0.16-0.80)的携带者发生膀胱癌的风险显著降低。基因交互作用分析显示XRCC3基因两位点(rs1799794和rs861530)组成了最佳互作模型,具有最高的检验准确度(0.701)以及最大的交叉验证一致性(Cross-validationconsistency=10,P=0.001)。另外,膀胱癌患者APEX1基因rs1130409位点变异基因型相比野生型纯合子,其吸烟生活习惯与膀胱癌的发生有显著相关性(P0.001,adjusted OR=1.32,95%CI:1.10-1.63);膀胱癌患者XRCC1基因rs3213356位点、MUTYH基因rs3219493位点和APEX1基因rs3136817位点变异基因型相比野生型纯合子诊断时为高级别的风险相对较高(P0.001,adjusted OR=1.91,95%CI:1.22 3.02;P0.001,adjusted OR=1.44,95%CI:1.13 1.62;P0.001,adjusted OR=3.43,95%CI:1.64 7.51);经分层后对非肌层浸润性膀胱癌进一步分析发现,APEX1基因rs3136817位点变异基因型相比野生型纯合子诊断时为高危的风险相对较低(P0.001,adjusted OR=0.83,95%CI:0.81-0.90);APEX1基因rs3136817位点和XRCC2基因rs3218454位点变异基因型相比野生型纯合子复发的风险相对较高(P0.001,adjusted OR=0.73,95%CI:0.64-0.80;P0.001,adjusted OR=0.72,95%CI:0.63-0.82)。以上结果经FDR校正后依然具有统计学上的显著性(QFDR0.05)。多变量生存分析发现XRCC2基因rs3218408位点变异基因型相比野生型纯合子,生存时间相对较长(P=0.04;HR=0.11,95%CI:0.01-0.93)。结论:DNA损伤修复基因多个单核苷酸多态性位点和单体型与膀胱癌的发生风险有显著相关性,其中XRCC3基因的两个位点组合(rs1799794和rs861530)与膀胱癌的发生风险有显著相关性。多个单核苷酸多态性位点膀胱癌患者的临床病理特征和预后具有显著相关性。
[Abstract]:......
【学位授予单位】：兰州大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R737.14
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，本文编号：1735108
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