草酸钠结晶肾损伤肾小管上皮细胞中骨桥蛋白相关长链非编码RNA的差异表达

发布时间：2018-08-16 12:12

【摘要】：目的检测草酸钠诱导的人肾小管上皮细胞结晶肾损伤模型中与骨桥蛋白(OPN)相关的长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达,并探讨OPN相关lncRNA在结晶肾损伤发病中的作用。方法利用草酸钠(20 mmol/L)刺激人肾近曲小管上皮细胞HK-2建立草酸钠诱导的结晶肾损伤肾小管上皮细胞模型。运用RNA干扰技术对其转染OPN小干扰RNA构建OPN敲低细胞模型(OPN-siRNA组),对照组细胞转染阴性随机对照序列(NC-siRNA组)。采用Arraystar公司提供的人类全基因组lncRNA芯片(V4.0)检测两组结晶肾损伤肾小管上皮细胞模型中与OPN相关的lncRNA和mRNA的差异表达水平,并采用生物信息学方法分析lncRNA芯片结果。结果全基因组lncRNA芯片结果显示草酸钠诱导的结晶肾损伤肾小管上皮细胞模型中与OPN相关的差异表达lncRNA共583个,其中OPN-siRNA组表达上调354个、下调229个;差异表达mRNA共235个,上调139个,下调96个。生物信息学分析结果显示差异表达lncRNA参与结晶肾损伤中细胞生长、酶活性调节等多种生物学过程。结论草酸钠体外诱导的结晶肾损伤肾小管上皮细胞模型中存在OPN相关的差异表达的lncRNA。
[Abstract]:Objective to investigate the differential expression of long chain non-coding RNA (lncRNA) associated with osteopontin (OPN) in cultured human renal tubular epithelial cells induced by sodium oxalate, and to explore the role of OPN related lncRNA in the pathogenesis of renal injury. Methods Sodium oxalate (20 mmol/L) was used to stimulate human proximal tubule epithelial cells (HK-2) to establish the model of renal tubular epithelial cells induced by sodium oxalate. RNA interference technique was used to construct OPN knockdown cell model (OPN-siRNA group) and control cell transfection negative random control sequence (NC-siRNA group) to construct OPN knockout cell model (OPN-siRNA group). The differential expression levels of lncRNA and mRNA related to OPN in two groups of renal tubular epithelial cell models with crystalline renal injury were detected by using human genome lncRNA chip (V4.0) provided by Arraystar. The results of lncRNA microarray were analyzed by bioinformatics. Results the results of genomic lncRNA microarray showed that there were 583 differentially expressed lncRNA related to OPN in renal tubular epithelial cell model induced by sodium oxalate, including 354 up-regulated and 229 down-regulated lncRNA in OPN-siRNA group, and 235 differentially expressed mRNA in all of them. Upregulation 139, down 96. Bioinformatics analysis showed that differential expression of lncRNA was involved in many biological processes such as cell growth and regulation of enzyme activity in crystalline kidney injury. Conclusion there is a differential expression of OPN related to OPN in the model of renal tubular epithelial cells induced by sodium oxalate in vitro.
【作者单位】： 第二军医大学长海医院肾内科;第二军医大学基础部医学遗传学研究所;
【基金】：国家自然科学基金(81270773,81573759) 上海市科委中药支撑计划(13401900105) 上海市教委科研创新重点项目(14ZZ080)~~
【分类号】：R692.4

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